Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSY8

Sgo2, Shugoshin 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgo2Q7TSY8 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sgo2Q7TSY8 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Sgo2Q7TSY8 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sgo2Q7TSY8 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sgo2Q7TSY8 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sgo2Q7TSY8 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sgo2Q7TSY8 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sgo2Q7TSY8 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sgo2Q7TSY8 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sgo2Q7TSY8 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sgo2Q7TSY8 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sgo2Q7TSY8 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sgo2Q7TSY8 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sgo2Q7TSY8 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sgo2Q7TSY8 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sgo2Q7TSY8 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sgo2Q7TSY8 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sgo2Q7TSY8 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Sgo2Q7TSY8 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sgo2Q7TSY8 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sgo2Q7TSY8 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sgo2Q7TSY8 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sgo2Q7TSY8 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Sgo2Q7TSY8 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sgo2Q7TSY8 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sgo2Q7TSY8 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sgo2Q7TSY8 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sgo2Q7TSY8 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sgo2Q7TSY8 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sgo2Q7TSY8 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Sgo2Q7TSY8 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sgo2Q7TSY8 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sgo2Q7TSY8 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sgo2Q7TSY8 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sgo2Q7TSY8 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sgo2Q7TSY8 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sgo2Q7TSY8 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sgo2Q7TSY8 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sgo2Q7TSY8 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sgo2Q7TSY8 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sgo2Q7TSY8 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sgo2Q7TSY8 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sgo2Q7TSY8 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sgo2Q7TSY8 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sgo2Q7TSY8 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sgo2Q7TSY8 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sgo2Q7TSY8 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sgo2Q7TSY8 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sgo2Q7TSY8 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sgo2Q7TSY8 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Sgo2Q7TSY8 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sgo2Q7TSY8 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sgo2Q7TSY8 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sgo2Q7TSY8 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sgo2Q7TSY8 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sgo2Q7TSY8 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sgo2Q7TSY8 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sgo2Q7TSY8 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sgo2Q7TSY8 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sgo2Q7TSY8 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sgo2Q7TSY8 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sgo2Q7TSY8 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sgo2Q7TSY8 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sgo2Q7TSY8 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sgo2Q7TSY8 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sgo2Q7TSY8 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sgo2Q7TSY8 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sgo2Q7TSY8 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sgo2Q7TSY8 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sgo2Q7TSY8 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sgo2Q7TSY8 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sgo2Q7TSY8 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sgo2Q7TSY8 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sgo2Q7TSY8 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sgo2Q7TSY8 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sgo2Q7TSY8 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Sgo2Q7TSY8 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Sgo2Q7TSY8 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Sgo2Q7TSY8 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Sgo2Q7TSY8 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Sgo2Q7TSY8 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sgo2Q7TSY8 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sgo2Q7TSY8 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sgo2Q7TSY8 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sgo2Q7TSY8 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sgo2Q7TSY8 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sgo2Q7TSY8 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sgo2Q7TSY8 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sgo2Q7TSY8 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sgo2Q7TSY8 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Sgo2Q7TSY8 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sgo2Q7TSY8 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sgo2Q7TSY8 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sgo2Q7TSY8 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sgo2Q7TSY8 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sgo2Q7TSY8 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sgo2Q7TSY8 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sgo2Q7TSY8 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sgo2Q7TSY8 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sgo2Q7TSY8 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.5 ms