Protein–RNA interactions for Protein: Q7TST5

Lamp3, Lysosome-associated membrane glycoprotein 3, mousemouse

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lamp3Q7TST5 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lamp3Q7TST5 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lamp3Q7TST5 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Lamp3Q7TST5 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lamp3Q7TST5 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lamp3Q7TST5 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lamp3Q7TST5 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lamp3Q7TST5 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lamp3Q7TST5 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lamp3Q7TST5 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Lamp3Q7TST5 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lamp3Q7TST5 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lamp3Q7TST5 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lamp3Q7TST5 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lamp3Q7TST5 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lamp3Q7TST5 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lamp3Q7TST5 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lamp3Q7TST5 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lamp3Q7TST5 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lamp3Q7TST5 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lamp3Q7TST5 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lamp3Q7TST5 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lamp3Q7TST5 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lamp3Q7TST5 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lamp3Q7TST5 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lamp3Q7TST5 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lamp3Q7TST5 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lamp3Q7TST5 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Lamp3Q7TST5 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lamp3Q7TST5 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lamp3Q7TST5 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lamp3Q7TST5 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Lamp3Q7TST5 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lamp3Q7TST5 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lamp3Q7TST5 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lamp3Q7TST5 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lamp3Q7TST5 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lamp3Q7TST5 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lamp3Q7TST5 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lamp3Q7TST5 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Lamp3Q7TST5 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lamp3Q7TST5 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lamp3Q7TST5 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Lamp3Q7TST5 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lamp3Q7TST5 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lamp3Q7TST5 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Lamp3Q7TST5 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lamp3Q7TST5 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lamp3Q7TST5 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Lamp3Q7TST5 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lamp3Q7TST5 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lamp3Q7TST5 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lamp3Q7TST5 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lamp3Q7TST5 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lamp3Q7TST5 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lamp3Q7TST5 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lamp3Q7TST5 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lamp3Q7TST5 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lamp3Q7TST5 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lamp3Q7TST5 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lamp3Q7TST5 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lamp3Q7TST5 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lamp3Q7TST5 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lamp3Q7TST5 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lamp3Q7TST5 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Lamp3Q7TST5 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lamp3Q7TST5 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Lamp3Q7TST5 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Lamp3Q7TST5 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lamp3Q7TST5 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Lamp3Q7TST5 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Lamp3Q7TST5 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Lamp3Q7TST5 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Lamp3Q7TST5 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Lamp3Q7TST5 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Lamp3Q7TST5 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Lamp3Q7TST5 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Lamp3Q7TST5 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Lamp3Q7TST5 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Lamp3Q7TST5 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Lamp3Q7TST5 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Lamp3Q7TST5 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lamp3Q7TST5 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lamp3Q7TST5 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lamp3Q7TST5 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lamp3Q7TST5 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lamp3Q7TST5 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Lamp3Q7TST5 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lamp3Q7TST5 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lamp3Q7TST5 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lamp3Q7TST5 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lamp3Q7TST5 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lamp3Q7TST5 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Lamp3Q7TST5 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lamp3Q7TST5 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lamp3Q7TST5 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Lamp3Q7TST5 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Lamp3Q7TST5 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lamp3Q7TST5 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lamp3Q7TST5 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59 ms