Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSN2

Clm, CMRF35-like molecule, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClmQ7TSN2 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ClmQ7TSN2 Gm19324-201ENSMUST00000213229 1169 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
ClmQ7TSN2 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ClmQ7TSN2 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
ClmQ7TSN2 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
ClmQ7TSN2 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ClmQ7TSN2 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ClmQ7TSN2 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ClmQ7TSN2 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ClmQ7TSN2 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ClmQ7TSN2 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ClmQ7TSN2 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ClmQ7TSN2 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ClmQ7TSN2 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ClmQ7TSN2 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ClmQ7TSN2 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ClmQ7TSN2 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ClmQ7TSN2 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ClmQ7TSN2 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ClmQ7TSN2 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ClmQ7TSN2 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ClmQ7TSN2 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ClmQ7TSN2 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
ClmQ7TSN2 G530012D18Rik-201ENSMUST00000178024 420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ClmQ7TSN2 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
ClmQ7TSN2 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ClmQ7TSN2 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
ClmQ7TSN2 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ClmQ7TSN2 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ClmQ7TSN2 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ClmQ7TSN2 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ClmQ7TSN2 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ClmQ7TSN2 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ClmQ7TSN2 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ClmQ7TSN2 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ClmQ7TSN2 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ClmQ7TSN2 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ClmQ7TSN2 Clec4d-201ENSMUST00000032240 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ClmQ7TSN2 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ClmQ7TSN2 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ClmQ7TSN2 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ClmQ7TSN2 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ClmQ7TSN2 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ClmQ7TSN2 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ClmQ7TSN2 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ClmQ7TSN2 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ClmQ7TSN2 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ClmQ7TSN2 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ClmQ7TSN2 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ClmQ7TSN2 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ClmQ7TSN2 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
ClmQ7TSN2 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ClmQ7TSN2 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ClmQ7TSN2 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ClmQ7TSN2 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
ClmQ7TSN2 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
ClmQ7TSN2 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ClmQ7TSN2 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ClmQ7TSN2 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ClmQ7TSN2 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ClmQ7TSN2 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ClmQ7TSN2 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ClmQ7TSN2 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ClmQ7TSN2 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ClmQ7TSN2 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ClmQ7TSN2 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ClmQ7TSN2 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
ClmQ7TSN2 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ClmQ7TSN2 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ClmQ7TSN2 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ClmQ7TSN2 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ClmQ7TSN2 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ClmQ7TSN2 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ClmQ7TSN2 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ClmQ7TSN2 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ClmQ7TSN2 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ClmQ7TSN2 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ClmQ7TSN2 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ClmQ7TSN2 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ClmQ7TSN2 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ClmQ7TSN2 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ClmQ7TSN2 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ClmQ7TSN2 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ClmQ7TSN2 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ClmQ7TSN2 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ClmQ7TSN2 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ClmQ7TSN2 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ClmQ7TSN2 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ClmQ7TSN2 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ClmQ7TSN2 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ClmQ7TSN2 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ClmQ7TSN2 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ClmQ7TSN2 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ClmQ7TSN2 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ClmQ7TSN2 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ClmQ7TSN2 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ClmQ7TSN2 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ClmQ7TSN2 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
ClmQ7TSN2 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ClmQ7TSN2 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.5 ms