Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSH2

Phkb, Phosphorylase b kinase regulatory subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,085 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PhkbQ7TSH2 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PhkbQ7TSH2 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PhkbQ7TSH2 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PhkbQ7TSH2 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PhkbQ7TSH2 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PhkbQ7TSH2 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PhkbQ7TSH2 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PhkbQ7TSH2 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PhkbQ7TSH2 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PhkbQ7TSH2 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PhkbQ7TSH2 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PhkbQ7TSH2 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PhkbQ7TSH2 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PhkbQ7TSH2 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PhkbQ7TSH2 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PhkbQ7TSH2 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PhkbQ7TSH2 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PhkbQ7TSH2 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PhkbQ7TSH2 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PhkbQ7TSH2 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PhkbQ7TSH2 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PhkbQ7TSH2 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PhkbQ7TSH2 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PhkbQ7TSH2 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PhkbQ7TSH2 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
PhkbQ7TSH2 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PhkbQ7TSH2 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PhkbQ7TSH2 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PhkbQ7TSH2 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PhkbQ7TSH2 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PhkbQ7TSH2 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PhkbQ7TSH2 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
PhkbQ7TSH2 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
PhkbQ7TSH2 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PhkbQ7TSH2 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PhkbQ7TSH2 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PhkbQ7TSH2 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PhkbQ7TSH2 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PhkbQ7TSH2 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PhkbQ7TSH2 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PhkbQ7TSH2 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PhkbQ7TSH2 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PhkbQ7TSH2 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PhkbQ7TSH2 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PhkbQ7TSH2 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PhkbQ7TSH2 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PhkbQ7TSH2 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PhkbQ7TSH2 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PhkbQ7TSH2 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PhkbQ7TSH2 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PhkbQ7TSH2 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PhkbQ7TSH2 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PhkbQ7TSH2 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PhkbQ7TSH2 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PhkbQ7TSH2 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PhkbQ7TSH2 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PhkbQ7TSH2 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PhkbQ7TSH2 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PhkbQ7TSH2 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PhkbQ7TSH2 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PhkbQ7TSH2 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PhkbQ7TSH2 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PhkbQ7TSH2 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PhkbQ7TSH2 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PhkbQ7TSH2 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PhkbQ7TSH2 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
PhkbQ7TSH2 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PhkbQ7TSH2 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PhkbQ7TSH2 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PhkbQ7TSH2 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PhkbQ7TSH2 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PhkbQ7TSH2 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PhkbQ7TSH2 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PhkbQ7TSH2 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PhkbQ7TSH2 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PhkbQ7TSH2 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PhkbQ7TSH2 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PhkbQ7TSH2 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PhkbQ7TSH2 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PhkbQ7TSH2 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PhkbQ7TSH2 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
PhkbQ7TSH2 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PhkbQ7TSH2 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PhkbQ7TSH2 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PhkbQ7TSH2 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PhkbQ7TSH2 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PhkbQ7TSH2 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PhkbQ7TSH2 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
PhkbQ7TSH2 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
PhkbQ7TSH2 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
PhkbQ7TSH2 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PhkbQ7TSH2 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PhkbQ7TSH2 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PhkbQ7TSH2 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PhkbQ7TSH2 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PhkbQ7TSH2 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PhkbQ7TSH2 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PhkbQ7TSH2 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PhkbQ7TSH2 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PhkbQ7TSH2 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms