Protein–RNA interactions for Protein: Q7TS55

Tnfsf18, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 18, mousemouse

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Length 173 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf18Q7TS55 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Tnfsf18Q7TS55 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tnfsf18Q7TS55 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Tnfsf18Q7TS55 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tnfsf18Q7TS55 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Tnfsf18Q7TS55 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tnfsf18Q7TS55 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Tnfsf18Q7TS55 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tnfsf18Q7TS55 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Tnfsf18Q7TS55 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tnfsf18Q7TS55 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tnfsf18Q7TS55 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tnfsf18Q7TS55 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Tnfsf18Q7TS55 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tnfsf18Q7TS55 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Tnfsf18Q7TS55 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tnfsf18Q7TS55 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Tnfsf18Q7TS55 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Tnfsf18Q7TS55 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tnfsf18Q7TS55 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tnfsf18Q7TS55 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tnfsf18Q7TS55 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Tnfsf18Q7TS55 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tnfsf18Q7TS55 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tnfsf18Q7TS55 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tnfsf18Q7TS55 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tnfsf18Q7TS55 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tnfsf18Q7TS55 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tnfsf18Q7TS55 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tnfsf18Q7TS55 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tnfsf18Q7TS55 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tnfsf18Q7TS55 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tnfsf18Q7TS55 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tnfsf18Q7TS55 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tnfsf18Q7TS55 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tnfsf18Q7TS55 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tnfsf18Q7TS55 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tnfsf18Q7TS55 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tnfsf18Q7TS55 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tnfsf18Q7TS55 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tnfsf18Q7TS55 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tnfsf18Q7TS55 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tnfsf18Q7TS55 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tnfsf18Q7TS55 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tnfsf18Q7TS55 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tnfsf18Q7TS55 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tnfsf18Q7TS55 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tnfsf18Q7TS55 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tnfsf18Q7TS55 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tnfsf18Q7TS55 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tnfsf18Q7TS55 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tnfsf18Q7TS55 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tnfsf18Q7TS55 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tnfsf18Q7TS55 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tnfsf18Q7TS55 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Tnfsf18Q7TS55 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tnfsf18Q7TS55 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tnfsf18Q7TS55 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tnfsf18Q7TS55 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tnfsf18Q7TS55 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tnfsf18Q7TS55 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tnfsf18Q7TS55 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tnfsf18Q7TS55 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tnfsf18Q7TS55 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tnfsf18Q7TS55 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tnfsf18Q7TS55 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tnfsf18Q7TS55 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tnfsf18Q7TS55 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tnfsf18Q7TS55 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tnfsf18Q7TS55 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tnfsf18Q7TS55 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tnfsf18Q7TS55 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tnfsf18Q7TS55 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Tnfsf18Q7TS55 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tnfsf18Q7TS55 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tnfsf18Q7TS55 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Tnfsf18Q7TS55 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Tnfsf18Q7TS55 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Tnfsf18Q7TS55 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Tnfsf18Q7TS55 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Tnfsf18Q7TS55 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Tnfsf18Q7TS55 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Tnfsf18Q7TS55 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Tnfsf18Q7TS55 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Tnfsf18Q7TS55 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Tnfsf18Q7TS55 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Tnfsf18Q7TS55 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Tnfsf18Q7TS55 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Tnfsf18Q7TS55 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Tnfsf18Q7TS55 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Tnfsf18Q7TS55 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Tnfsf18Q7TS55 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Tnfsf18Q7TS55 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Tnfsf18Q7TS55 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Tnfsf18Q7TS55 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Tnfsf18Q7TS55 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Tnfsf18Q7TS55 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Tnfsf18Q7TS55 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Tnfsf18Q7TS55 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Tnfsf18Q7TS55 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
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