Protein–RNA interactions for Protein: Q7TNB8

Sbno2, Protein strawberry notch homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sbno2Q7TNB8 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sbno2Q7TNB8 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sbno2Q7TNB8 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sbno2Q7TNB8 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Sbno2Q7TNB8 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sbno2Q7TNB8 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sbno2Q7TNB8 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sbno2Q7TNB8 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sbno2Q7TNB8 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Sbno2Q7TNB8 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sbno2Q7TNB8 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sbno2Q7TNB8 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Sbno2Q7TNB8 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sbno2Q7TNB8 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sbno2Q7TNB8 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sbno2Q7TNB8 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sbno2Q7TNB8 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sbno2Q7TNB8 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sbno2Q7TNB8 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sbno2Q7TNB8 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sbno2Q7TNB8 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sbno2Q7TNB8 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sbno2Q7TNB8 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sbno2Q7TNB8 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sbno2Q7TNB8 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sbno2Q7TNB8 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sbno2Q7TNB8 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sbno2Q7TNB8 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sbno2Q7TNB8 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sbno2Q7TNB8 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sbno2Q7TNB8 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sbno2Q7TNB8 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sbno2Q7TNB8 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sbno2Q7TNB8 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sbno2Q7TNB8 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sbno2Q7TNB8 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sbno2Q7TNB8 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sbno2Q7TNB8 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sbno2Q7TNB8 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sbno2Q7TNB8 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sbno2Q7TNB8 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sbno2Q7TNB8 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sbno2Q7TNB8 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sbno2Q7TNB8 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sbno2Q7TNB8 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sbno2Q7TNB8 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sbno2Q7TNB8 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sbno2Q7TNB8 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Sbno2Q7TNB8 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sbno2Q7TNB8 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sbno2Q7TNB8 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sbno2Q7TNB8 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sbno2Q7TNB8 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sbno2Q7TNB8 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Sbno2Q7TNB8 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Sbno2Q7TNB8 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Sbno2Q7TNB8 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Sbno2Q7TNB8 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Sbno2Q7TNB8 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Sbno2Q7TNB8 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Sbno2Q7TNB8 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Sbno2Q7TNB8 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Sbno2Q7TNB8 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Sbno2Q7TNB8 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Sbno2Q7TNB8 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Sbno2Q7TNB8 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Sbno2Q7TNB8 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Sbno2Q7TNB8 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Sbno2Q7TNB8 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Sbno2Q7TNB8 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Sbno2Q7TNB8 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Sbno2Q7TNB8 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Sbno2Q7TNB8 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Sbno2Q7TNB8 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sbno2Q7TNB8 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sbno2Q7TNB8 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sbno2Q7TNB8 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sbno2Q7TNB8 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sbno2Q7TNB8 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sbno2Q7TNB8 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Sbno2Q7TNB8 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sbno2Q7TNB8 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sbno2Q7TNB8 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sbno2Q7TNB8 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sbno2Q7TNB8 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sbno2Q7TNB8 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sbno2Q7TNB8 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sbno2Q7TNB8 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sbno2Q7TNB8 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sbno2Q7TNB8 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sbno2Q7TNB8 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sbno2Q7TNB8 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sbno2Q7TNB8 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sbno2Q7TNB8 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sbno2Q7TNB8 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sbno2Q7TNB8 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sbno2Q7TNB8 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sbno2Q7TNB8 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sbno2Q7TNB8 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sbno2Q7TNB8 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms