Protein–RNA interactions for Protein: Q7TN88

Pkd1l2, Polycystic kidney disease protein 1-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 2,461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkd1l2Q7TN88 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Pkd1l2Q7TN88 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Pkd1l2Q7TN88 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Pkd1l2Q7TN88 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pkd1l2Q7TN88 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pkd1l2Q7TN88 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pkd1l2Q7TN88 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pkd1l2Q7TN88 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pkd1l2Q7TN88 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pkd1l2Q7TN88 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pkd1l2Q7TN88 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pkd1l2Q7TN88 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Pkd1l2Q7TN88 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pkd1l2Q7TN88 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pkd1l2Q7TN88 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pkd1l2Q7TN88 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Pkd1l2Q7TN88 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pkd1l2Q7TN88 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pkd1l2Q7TN88 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pkd1l2Q7TN88 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Pkd1l2Q7TN88 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pkd1l2Q7TN88 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pkd1l2Q7TN88 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pkd1l2Q7TN88 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Pkd1l2Q7TN88 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pkd1l2Q7TN88 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pkd1l2Q7TN88 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Pkd1l2Q7TN88 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pkd1l2Q7TN88 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Pkd1l2Q7TN88 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pkd1l2Q7TN88 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Pkd1l2Q7TN88 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pkd1l2Q7TN88 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Pkd1l2Q7TN88 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pkd1l2Q7TN88 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pkd1l2Q7TN88 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pkd1l2Q7TN88 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pkd1l2Q7TN88 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pkd1l2Q7TN88 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pkd1l2Q7TN88 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pkd1l2Q7TN88 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pkd1l2Q7TN88 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pkd1l2Q7TN88 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Pkd1l2Q7TN88 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Pkd1l2Q7TN88 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Pkd1l2Q7TN88 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pkd1l2Q7TN88 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pkd1l2Q7TN88 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pkd1l2Q7TN88 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Pkd1l2Q7TN88 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Pkd1l2Q7TN88 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Pkd1l2Q7TN88 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Pkd1l2Q7TN88 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Pkd1l2Q7TN88 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pkd1l2Q7TN88 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pkd1l2Q7TN88 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pkd1l2Q7TN88 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pkd1l2Q7TN88 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pkd1l2Q7TN88 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Pkd1l2Q7TN88 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Pkd1l2Q7TN88 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Pkd1l2Q7TN88 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Pkd1l2Q7TN88 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Pkd1l2Q7TN88 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Pkd1l2Q7TN88 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Pkd1l2Q7TN88 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Pkd1l2Q7TN88 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pkd1l2Q7TN88 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Pkd1l2Q7TN88 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pkd1l2Q7TN88 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pkd1l2Q7TN88 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pkd1l2Q7TN88 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Pkd1l2Q7TN88 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pkd1l2Q7TN88 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pkd1l2Q7TN88 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pkd1l2Q7TN88 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pkd1l2Q7TN88 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pkd1l2Q7TN88 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pkd1l2Q7TN88 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Pkd1l2Q7TN88 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pkd1l2Q7TN88 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pkd1l2Q7TN88 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pkd1l2Q7TN88 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Pkd1l2Q7TN88 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Pkd1l2Q7TN88 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Pkd1l2Q7TN88 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Pkd1l2Q7TN88 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pkd1l2Q7TN88 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Pkd1l2Q7TN88 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pkd1l2Q7TN88 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Pkd1l2Q7TN88 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Pkd1l2Q7TN88 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Pkd1l2Q7TN88 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Pkd1l2Q7TN88 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pkd1l2Q7TN88 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Pkd1l2Q7TN88 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pkd1l2Q7TN88 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pkd1l2Q7TN88 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Pkd1l2Q7TN88 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pkd1l2Q7TN88 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms