Protein–RNA interactions for Protein: Q7TN16

Hhip, Hedgehog-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 700 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HhipQ7TN16 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HhipQ7TN16 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
HhipQ7TN16 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
HhipQ7TN16 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
HhipQ7TN16 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HhipQ7TN16 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HhipQ7TN16 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
HhipQ7TN16 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
HhipQ7TN16 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
HhipQ7TN16 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
HhipQ7TN16 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HhipQ7TN16 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HhipQ7TN16 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HhipQ7TN16 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HhipQ7TN16 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HhipQ7TN16 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
HhipQ7TN16 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
HhipQ7TN16 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HhipQ7TN16 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HhipQ7TN16 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
HhipQ7TN16 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
HhipQ7TN16 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
HhipQ7TN16 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HhipQ7TN16 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HhipQ7TN16 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HhipQ7TN16 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HhipQ7TN16 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HhipQ7TN16 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HhipQ7TN16 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
HhipQ7TN16 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HhipQ7TN16 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HhipQ7TN16 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HhipQ7TN16 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
HhipQ7TN16 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
HhipQ7TN16 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
HhipQ7TN16 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
HhipQ7TN16 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
HhipQ7TN16 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
HhipQ7TN16 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
HhipQ7TN16 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
HhipQ7TN16 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
HhipQ7TN16 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
HhipQ7TN16 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
HhipQ7TN16 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
HhipQ7TN16 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
HhipQ7TN16 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
HhipQ7TN16 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
HhipQ7TN16 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
HhipQ7TN16 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
HhipQ7TN16 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
HhipQ7TN16 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
HhipQ7TN16 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
HhipQ7TN16 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
HhipQ7TN16 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
HhipQ7TN16 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
HhipQ7TN16 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
HhipQ7TN16 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
HhipQ7TN16 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
HhipQ7TN16 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
HhipQ7TN16 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
HhipQ7TN16 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
HhipQ7TN16 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
HhipQ7TN16 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
HhipQ7TN16 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
HhipQ7TN16 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
HhipQ7TN16 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
HhipQ7TN16 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
HhipQ7TN16 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
HhipQ7TN16 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
HhipQ7TN16 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
HhipQ7TN16 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
HhipQ7TN16 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
HhipQ7TN16 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
HhipQ7TN16 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
HhipQ7TN16 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
HhipQ7TN16 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
HhipQ7TN16 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
HhipQ7TN16 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
HhipQ7TN16 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
HhipQ7TN16 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
HhipQ7TN16 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
HhipQ7TN16 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
HhipQ7TN16 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
HhipQ7TN16 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
HhipQ7TN16 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
HhipQ7TN16 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
HhipQ7TN16 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
HhipQ7TN16 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
HhipQ7TN16 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
HhipQ7TN16 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
HhipQ7TN16 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
HhipQ7TN16 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
HhipQ7TN16 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
HhipQ7TN16 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
HhipQ7TN16 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
HhipQ7TN16 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
HhipQ7TN16 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
HhipQ7TN16 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
HhipQ7TN16 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
HhipQ7TN16 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms