Protein–RNA interactions for Protein: Q7TMI3

Uhrf2, E3 ubiquitin-protein ligase UHRF2, mousemouse

Predictions only

Length 803 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uhrf2Q7TMI3 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Uhrf2Q7TMI3 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Uhrf2Q7TMI3 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Uhrf2Q7TMI3 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Uhrf2Q7TMI3 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Uhrf2Q7TMI3 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Uhrf2Q7TMI3 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Uhrf2Q7TMI3 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Uhrf2Q7TMI3 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Uhrf2Q7TMI3 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Uhrf2Q7TMI3 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Uhrf2Q7TMI3 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Uhrf2Q7TMI3 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Uhrf2Q7TMI3 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Uhrf2Q7TMI3 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Uhrf2Q7TMI3 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Uhrf2Q7TMI3 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Uhrf2Q7TMI3 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Uhrf2Q7TMI3 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Uhrf2Q7TMI3 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Uhrf2Q7TMI3 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Uhrf2Q7TMI3 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Uhrf2Q7TMI3 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Uhrf2Q7TMI3 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Uhrf2Q7TMI3 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Uhrf2Q7TMI3 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Uhrf2Q7TMI3 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Uhrf2Q7TMI3 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Uhrf2Q7TMI3 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Uhrf2Q7TMI3 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Uhrf2Q7TMI3 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Uhrf2Q7TMI3 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Uhrf2Q7TMI3 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Uhrf2Q7TMI3 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Uhrf2Q7TMI3 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Uhrf2Q7TMI3 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Uhrf2Q7TMI3 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Uhrf2Q7TMI3 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Uhrf2Q7TMI3 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Uhrf2Q7TMI3 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Uhrf2Q7TMI3 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Uhrf2Q7TMI3 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Uhrf2Q7TMI3 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Uhrf2Q7TMI3 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Uhrf2Q7TMI3 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Uhrf2Q7TMI3 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Uhrf2Q7TMI3 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Uhrf2Q7TMI3 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Uhrf2Q7TMI3 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Uhrf2Q7TMI3 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Uhrf2Q7TMI3 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Uhrf2Q7TMI3 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Uhrf2Q7TMI3 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Uhrf2Q7TMI3 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Uhrf2Q7TMI3 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Uhrf2Q7TMI3 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Uhrf2Q7TMI3 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Uhrf2Q7TMI3 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Uhrf2Q7TMI3 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Uhrf2Q7TMI3 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Uhrf2Q7TMI3 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Uhrf2Q7TMI3 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Uhrf2Q7TMI3 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Uhrf2Q7TMI3 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Uhrf2Q7TMI3 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Uhrf2Q7TMI3 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Uhrf2Q7TMI3 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Uhrf2Q7TMI3 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Uhrf2Q7TMI3 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Uhrf2Q7TMI3 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Uhrf2Q7TMI3 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Uhrf2Q7TMI3 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Uhrf2Q7TMI3 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Uhrf2Q7TMI3 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Uhrf2Q7TMI3 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Uhrf2Q7TMI3 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Uhrf2Q7TMI3 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Uhrf2Q7TMI3 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Uhrf2Q7TMI3 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Uhrf2Q7TMI3 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Uhrf2Q7TMI3 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Uhrf2Q7TMI3 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Uhrf2Q7TMI3 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Uhrf2Q7TMI3 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Uhrf2Q7TMI3 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Uhrf2Q7TMI3 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Uhrf2Q7TMI3 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Uhrf2Q7TMI3 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Uhrf2Q7TMI3 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Uhrf2Q7TMI3 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Uhrf2Q7TMI3 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Uhrf2Q7TMI3 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Uhrf2Q7TMI3 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Uhrf2Q7TMI3 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Uhrf2Q7TMI3 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Uhrf2Q7TMI3 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Uhrf2Q7TMI3 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Uhrf2Q7TMI3 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Uhrf2Q7TMI3 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Uhrf2Q7TMI3 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms