Protein–RNA interactions for Protein: Q78Y63

Pdcl2, Phosducin-like protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcl2Q78Y63 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Pdcl2Q78Y63 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Pdcl2Q78Y63 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Pdcl2Q78Y63 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Pdcl2Q78Y63 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Pdcl2Q78Y63 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Pdcl2Q78Y63 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Pdcl2Q78Y63 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Pdcl2Q78Y63 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Pdcl2Q78Y63 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Pdcl2Q78Y63 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Pdcl2Q78Y63 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Pdcl2Q78Y63 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Pdcl2Q78Y63 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Pdcl2Q78Y63 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Pdcl2Q78Y63 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Pdcl2Q78Y63 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Pdcl2Q78Y63 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Pdcl2Q78Y63 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Pdcl2Q78Y63 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pdcl2Q78Y63 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pdcl2Q78Y63 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pdcl2Q78Y63 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pdcl2Q78Y63 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pdcl2Q78Y63 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pdcl2Q78Y63 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pdcl2Q78Y63 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pdcl2Q78Y63 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pdcl2Q78Y63 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pdcl2Q78Y63 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pdcl2Q78Y63 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Pdcl2Q78Y63 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pdcl2Q78Y63 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pdcl2Q78Y63 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pdcl2Q78Y63 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pdcl2Q78Y63 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pdcl2Q78Y63 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pdcl2Q78Y63 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pdcl2Q78Y63 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pdcl2Q78Y63 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pdcl2Q78Y63 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pdcl2Q78Y63 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pdcl2Q78Y63 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Pdcl2Q78Y63 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pdcl2Q78Y63 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pdcl2Q78Y63 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pdcl2Q78Y63 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pdcl2Q78Y63 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pdcl2Q78Y63 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pdcl2Q78Y63 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pdcl2Q78Y63 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pdcl2Q78Y63 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pdcl2Q78Y63 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Pdcl2Q78Y63 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pdcl2Q78Y63 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pdcl2Q78Y63 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pdcl2Q78Y63 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pdcl2Q78Y63 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pdcl2Q78Y63 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pdcl2Q78Y63 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pdcl2Q78Y63 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pdcl2Q78Y63 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pdcl2Q78Y63 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pdcl2Q78Y63 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pdcl2Q78Y63 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pdcl2Q78Y63 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pdcl2Q78Y63 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pdcl2Q78Y63 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Pdcl2Q78Y63 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pdcl2Q78Y63 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pdcl2Q78Y63 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pdcl2Q78Y63 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pdcl2Q78Y63 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pdcl2Q78Y63 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Pdcl2Q78Y63 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pdcl2Q78Y63 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pdcl2Q78Y63 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pdcl2Q78Y63 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pdcl2Q78Y63 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pdcl2Q78Y63 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pdcl2Q78Y63 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pdcl2Q78Y63 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pdcl2Q78Y63 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pdcl2Q78Y63 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pdcl2Q78Y63 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pdcl2Q78Y63 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pdcl2Q78Y63 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pdcl2Q78Y63 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pdcl2Q78Y63 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pdcl2Q78Y63 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pdcl2Q78Y63 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pdcl2Q78Y63 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pdcl2Q78Y63 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pdcl2Q78Y63 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pdcl2Q78Y63 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pdcl2Q78Y63 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Pdcl2Q78Y63 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pdcl2Q78Y63 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pdcl2Q78Y63 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pdcl2Q78Y63 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms