Protein–RNA interactions for Protein: Q78RX3

Smim12, Small integral membrane protein 12, mousemouse

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Length 92 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim12Q78RX3 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Smim12Q78RX3 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Smim12Q78RX3 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Smim12Q78RX3 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Smim12Q78RX3 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Smim12Q78RX3 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Smim12Q78RX3 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Smim12Q78RX3 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Smim12Q78RX3 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Smim12Q78RX3 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Smim12Q78RX3 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Smim12Q78RX3 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Smim12Q78RX3 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Smim12Q78RX3 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Smim12Q78RX3 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Smim12Q78RX3 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Smim12Q78RX3 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Smim12Q78RX3 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Smim12Q78RX3 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Smim12Q78RX3 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Smim12Q78RX3 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Smim12Q78RX3 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Smim12Q78RX3 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Smim12Q78RX3 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Smim12Q78RX3 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Smim12Q78RX3 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Smim12Q78RX3 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Smim12Q78RX3 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Smim12Q78RX3 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Smim12Q78RX3 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Smim12Q78RX3 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Smim12Q78RX3 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Smim12Q78RX3 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Smim12Q78RX3 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Smim12Q78RX3 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Smim12Q78RX3 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Smim12Q78RX3 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Smim12Q78RX3 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Smim12Q78RX3 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Smim12Q78RX3 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Smim12Q78RX3 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Smim12Q78RX3 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Smim12Q78RX3 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Smim12Q78RX3 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Smim12Q78RX3 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Smim12Q78RX3 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Smim12Q78RX3 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Smim12Q78RX3 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Smim12Q78RX3 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Smim12Q78RX3 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Smim12Q78RX3 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Smim12Q78RX3 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Smim12Q78RX3 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Smim12Q78RX3 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Smim12Q78RX3 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Smim12Q78RX3 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Smim12Q78RX3 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Smim12Q78RX3 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Smim12Q78RX3 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Smim12Q78RX3 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Smim12Q78RX3 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Smim12Q78RX3 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Smim12Q78RX3 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Smim12Q78RX3 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Smim12Q78RX3 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Smim12Q78RX3 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Smim12Q78RX3 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Smim12Q78RX3 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Smim12Q78RX3 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Smim12Q78RX3 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Smim12Q78RX3 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Smim12Q78RX3 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Smim12Q78RX3 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Smim12Q78RX3 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Smim12Q78RX3 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Smim12Q78RX3 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Smim12Q78RX3 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Smim12Q78RX3 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Smim12Q78RX3 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Smim12Q78RX3 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Smim12Q78RX3 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Smim12Q78RX3 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Smim12Q78RX3 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Smim12Q78RX3 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Smim12Q78RX3 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Smim12Q78RX3 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Smim12Q78RX3 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Smim12Q78RX3 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Smim12Q78RX3 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Smim12Q78RX3 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Smim12Q78RX3 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Smim12Q78RX3 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Smim12Q78RX3 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Smim12Q78RX3 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Smim12Q78RX3 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Smim12Q78RX3 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Smim12Q78RX3 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Smim12Q78RX3 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Smim12Q78RX3 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Smim12Q78RX3 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
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