Protein–RNA interactions for Protein: Q78JW9

Ubfd1, Ubiquitin domain-containing protein UBFD1, mousemouse

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Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubfd1Q78JW9 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ubfd1Q78JW9 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ubfd1Q78JW9 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ubfd1Q78JW9 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ubfd1Q78JW9 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ubfd1Q78JW9 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ubfd1Q78JW9 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Ubfd1Q78JW9 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Ubfd1Q78JW9 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Ubfd1Q78JW9 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ubfd1Q78JW9 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ubfd1Q78JW9 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ubfd1Q78JW9 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ubfd1Q78JW9 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ubfd1Q78JW9 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ubfd1Q78JW9 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ubfd1Q78JW9 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ubfd1Q78JW9 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ubfd1Q78JW9 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ubfd1Q78JW9 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ubfd1Q78JW9 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ubfd1Q78JW9 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ubfd1Q78JW9 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ubfd1Q78JW9 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ubfd1Q78JW9 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ubfd1Q78JW9 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ubfd1Q78JW9 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ubfd1Q78JW9 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ubfd1Q78JW9 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
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Ubfd1Q78JW9 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ubfd1Q78JW9 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ubfd1Q78JW9 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ubfd1Q78JW9 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ubfd1Q78JW9 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
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Ubfd1Q78JW9 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
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Ubfd1Q78JW9 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ubfd1Q78JW9 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ubfd1Q78JW9 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ubfd1Q78JW9 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
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Ubfd1Q78JW9 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
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Ubfd1Q78JW9 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
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Ubfd1Q78JW9 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ubfd1Q78JW9 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ubfd1Q78JW9 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
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Ubfd1Q78JW9 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
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Ubfd1Q78JW9 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
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Ubfd1Q78JW9 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ubfd1Q78JW9 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ubfd1Q78JW9 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
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Ubfd1Q78JW9 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ubfd1Q78JW9 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ubfd1Q78JW9 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ubfd1Q78JW9 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ubfd1Q78JW9 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ubfd1Q78JW9 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ubfd1Q78JW9 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ubfd1Q78JW9 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ubfd1Q78JW9 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ubfd1Q78JW9 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ubfd1Q78JW9 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ubfd1Q78JW9 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ubfd1Q78JW9 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ubfd1Q78JW9 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ubfd1Q78JW9 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Ubfd1Q78JW9 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ubfd1Q78JW9 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ubfd1Q78JW9 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ubfd1Q78JW9 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
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