Protein–RNA interactions for Protein: Q78IS1

Tmed3, Transmembrane emp24 domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 221 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed3Q78IS1 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tmed3Q78IS1 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tmed3Q78IS1 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tmed3Q78IS1 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tmed3Q78IS1 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tmed3Q78IS1 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tmed3Q78IS1 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tmed3Q78IS1 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tmed3Q78IS1 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tmed3Q78IS1 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Tmed3Q78IS1 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tmed3Q78IS1 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tmed3Q78IS1 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tmed3Q78IS1 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tmed3Q78IS1 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tmed3Q78IS1 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Tmed3Q78IS1 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tmed3Q78IS1 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tmed3Q78IS1 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tmed3Q78IS1 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tmed3Q78IS1 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tmed3Q78IS1 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tmed3Q78IS1 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tmed3Q78IS1 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tmed3Q78IS1 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tmed3Q78IS1 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tmed3Q78IS1 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tmed3Q78IS1 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tmed3Q78IS1 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tmed3Q78IS1 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tmed3Q78IS1 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tmed3Q78IS1 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tmed3Q78IS1 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tmed3Q78IS1 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tmed3Q78IS1 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tmed3Q78IS1 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tmed3Q78IS1 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Tmed3Q78IS1 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tmed3Q78IS1 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Tmed3Q78IS1 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tmed3Q78IS1 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tmed3Q78IS1 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tmed3Q78IS1 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tmed3Q78IS1 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tmed3Q78IS1 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tmed3Q78IS1 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tmed3Q78IS1 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Tmed3Q78IS1 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tmed3Q78IS1 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tmed3Q78IS1 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tmed3Q78IS1 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tmed3Q78IS1 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tmed3Q78IS1 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tmed3Q78IS1 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tmed3Q78IS1 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Tmed3Q78IS1 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tmed3Q78IS1 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Tmed3Q78IS1 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tmed3Q78IS1 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tmed3Q78IS1 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tmed3Q78IS1 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tmed3Q78IS1 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tmed3Q78IS1 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tmed3Q78IS1 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tmed3Q78IS1 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tmed3Q78IS1 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tmed3Q78IS1 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tmed3Q78IS1 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tmed3Q78IS1 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tmed3Q78IS1 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tmed3Q78IS1 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tmed3Q78IS1 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tmed3Q78IS1 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tmed3Q78IS1 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tmed3Q78IS1 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tmed3Q78IS1 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tmed3Q78IS1 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tmed3Q78IS1 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tmed3Q78IS1 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tmed3Q78IS1 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tmed3Q78IS1 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tmed3Q78IS1 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tmed3Q78IS1 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tmed3Q78IS1 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tmed3Q78IS1 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tmed3Q78IS1 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tmed3Q78IS1 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tmed3Q78IS1 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tmed3Q78IS1 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tmed3Q78IS1 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tmed3Q78IS1 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Tmed3Q78IS1 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Tmed3Q78IS1 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Tmed3Q78IS1 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Tmed3Q78IS1 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Tmed3Q78IS1 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Tmed3Q78IS1 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Tmed3Q78IS1 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Tmed3Q78IS1 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Tmed3Q78IS1 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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