Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQF0

Topbp1, DNA topoisomerase 2-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Topbp1Q6ZQF0 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Topbp1Q6ZQF0 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Topbp1Q6ZQF0 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Topbp1Q6ZQF0 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Topbp1Q6ZQF0 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Topbp1Q6ZQF0 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Topbp1Q6ZQF0 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Topbp1Q6ZQF0 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Topbp1Q6ZQF0 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Topbp1Q6ZQF0 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Topbp1Q6ZQF0 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Topbp1Q6ZQF0 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Topbp1Q6ZQF0 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Topbp1Q6ZQF0 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Topbp1Q6ZQF0 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Topbp1Q6ZQF0 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Topbp1Q6ZQF0 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Topbp1Q6ZQF0 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Topbp1Q6ZQF0 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Topbp1Q6ZQF0 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Topbp1Q6ZQF0 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Topbp1Q6ZQF0 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Topbp1Q6ZQF0 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Topbp1Q6ZQF0 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Topbp1Q6ZQF0 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Topbp1Q6ZQF0 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Topbp1Q6ZQF0 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Topbp1Q6ZQF0 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Topbp1Q6ZQF0 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Topbp1Q6ZQF0 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Topbp1Q6ZQF0 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Topbp1Q6ZQF0 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Topbp1Q6ZQF0 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Topbp1Q6ZQF0 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Topbp1Q6ZQF0 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Topbp1Q6ZQF0 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Topbp1Q6ZQF0 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Topbp1Q6ZQF0 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Topbp1Q6ZQF0 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Topbp1Q6ZQF0 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Topbp1Q6ZQF0 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Topbp1Q6ZQF0 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Topbp1Q6ZQF0 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Topbp1Q6ZQF0 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Topbp1Q6ZQF0 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Topbp1Q6ZQF0 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Topbp1Q6ZQF0 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Topbp1Q6ZQF0 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Topbp1Q6ZQF0 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Topbp1Q6ZQF0 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Topbp1Q6ZQF0 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Topbp1Q6ZQF0 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Topbp1Q6ZQF0 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Topbp1Q6ZQF0 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Topbp1Q6ZQF0 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Topbp1Q6ZQF0 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Topbp1Q6ZQF0 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Topbp1Q6ZQF0 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Topbp1Q6ZQF0 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Topbp1Q6ZQF0 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Topbp1Q6ZQF0 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Topbp1Q6ZQF0 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Topbp1Q6ZQF0 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Topbp1Q6ZQF0 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Topbp1Q6ZQF0 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Topbp1Q6ZQF0 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Topbp1Q6ZQF0 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Topbp1Q6ZQF0 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Topbp1Q6ZQF0 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Topbp1Q6ZQF0 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Topbp1Q6ZQF0 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Topbp1Q6ZQF0 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Topbp1Q6ZQF0 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Topbp1Q6ZQF0 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Topbp1Q6ZQF0 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Topbp1Q6ZQF0 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Topbp1Q6ZQF0 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Topbp1Q6ZQF0 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Topbp1Q6ZQF0 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Topbp1Q6ZQF0 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Topbp1Q6ZQF0 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Topbp1Q6ZQF0 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Topbp1Q6ZQF0 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Topbp1Q6ZQF0 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Topbp1Q6ZQF0 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Topbp1Q6ZQF0 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Topbp1Q6ZQF0 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Topbp1Q6ZQF0 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Topbp1Q6ZQF0 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Topbp1Q6ZQF0 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Topbp1Q6ZQF0 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Topbp1Q6ZQF0 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Topbp1Q6ZQF0 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Topbp1Q6ZQF0 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Topbp1Q6ZQF0 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Topbp1Q6ZQF0 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Topbp1Q6ZQF0 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Topbp1Q6ZQF0 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Topbp1Q6ZQF0 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Topbp1Q6ZQF0 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms