Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQ18

Efr3b, Protein EFR3 homolog B, mousemouse

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Length 817 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efr3bQ6ZQ18 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
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Efr3bQ6ZQ18 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
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Efr3bQ6ZQ18 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Efr3bQ6ZQ18 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
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Efr3bQ6ZQ18 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
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Efr3bQ6ZQ18 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
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Efr3bQ6ZQ18 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
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Efr3bQ6ZQ18 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Efr3bQ6ZQ18 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
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Efr3bQ6ZQ18 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Efr3bQ6ZQ18 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
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Efr3bQ6ZQ18 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Efr3bQ6ZQ18 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Efr3bQ6ZQ18 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Efr3bQ6ZQ18 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Efr3bQ6ZQ18 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Efr3bQ6ZQ18 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Efr3bQ6ZQ18 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Efr3bQ6ZQ18 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Efr3bQ6ZQ18 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Efr3bQ6ZQ18 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Efr3bQ6ZQ18 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Efr3bQ6ZQ18 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
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Efr3bQ6ZQ18 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms