Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZPV2

Ino80, DNA helicase INO80, mousemouse

Predictions only

Length 1,559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ino80Q6ZPV2 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ino80Q6ZPV2 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ino80Q6ZPV2 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ino80Q6ZPV2 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ino80Q6ZPV2 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ino80Q6ZPV2 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ino80Q6ZPV2 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ino80Q6ZPV2 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ino80Q6ZPV2 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ino80Q6ZPV2 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ino80Q6ZPV2 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ino80Q6ZPV2 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ino80Q6ZPV2 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ino80Q6ZPV2 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ino80Q6ZPV2 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Ino80Q6ZPV2 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC23.95■■□□□ 1.43
Ino80Q6ZPV2 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
Ino80Q6ZPV2 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ino80Q6ZPV2 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ino80Q6ZPV2 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ino80Q6ZPV2 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ino80Q6ZPV2 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Ino80Q6ZPV2 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ino80Q6ZPV2 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Ino80Q6ZPV2 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ino80Q6ZPV2 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ino80Q6ZPV2 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Ino80Q6ZPV2 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ino80Q6ZPV2 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ino80Q6ZPV2 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ino80Q6ZPV2 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ino80Q6ZPV2 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ino80Q6ZPV2 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ino80Q6ZPV2 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ino80Q6ZPV2 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ino80Q6ZPV2 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ino80Q6ZPV2 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ino80Q6ZPV2 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ino80Q6ZPV2 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ino80Q6ZPV2 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Ino80Q6ZPV2 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ino80Q6ZPV2 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ino80Q6ZPV2 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ino80Q6ZPV2 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ino80Q6ZPV2 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ino80Q6ZPV2 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ino80Q6ZPV2 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ino80Q6ZPV2 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Ino80Q6ZPV2 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ino80Q6ZPV2 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ino80Q6ZPV2 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ino80Q6ZPV2 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ino80Q6ZPV2 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Ino80Q6ZPV2 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ino80Q6ZPV2 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ino80Q6ZPV2 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ino80Q6ZPV2 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ino80Q6ZPV2 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ino80Q6ZPV2 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ino80Q6ZPV2 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ino80Q6ZPV2 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ino80Q6ZPV2 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ino80Q6ZPV2 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ino80Q6ZPV2 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ino80Q6ZPV2 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ino80Q6ZPV2 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ino80Q6ZPV2 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Ino80Q6ZPV2 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ino80Q6ZPV2 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ino80Q6ZPV2 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ino80Q6ZPV2 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Ino80Q6ZPV2 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Ino80Q6ZPV2 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ino80Q6ZPV2 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ino80Q6ZPV2 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ino80Q6ZPV2 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ino80Q6ZPV2 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ino80Q6ZPV2 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ino80Q6ZPV2 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ino80Q6ZPV2 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ino80Q6ZPV2 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ino80Q6ZPV2 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ino80Q6ZPV2 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Ino80Q6ZPV2 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ino80Q6ZPV2 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ino80Q6ZPV2 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ino80Q6ZPV2 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ino80Q6ZPV2 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ino80Q6ZPV2 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ino80Q6ZPV2 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ino80Q6ZPV2 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ino80Q6ZPV2 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Ino80Q6ZPV2 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ino80Q6ZPV2 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Ino80Q6ZPV2 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Ino80Q6ZPV2 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ino80Q6ZPV2 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ino80Q6ZPV2 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ino80Q6ZPV2 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ino80Q6ZPV2 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms