Protein–RNA interactions for Protein: Q6X893

Slc44a1, Choline transporter-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 653 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc44a1Q6X893 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Slc44a1Q6X893 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Slc44a1Q6X893 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Slc44a1Q6X893 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Slc44a1Q6X893 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Slc44a1Q6X893 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Slc44a1Q6X893 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Slc44a1Q6X893 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Slc44a1Q6X893 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Slc44a1Q6X893 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Slc44a1Q6X893 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Slc44a1Q6X893 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Slc44a1Q6X893 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Slc44a1Q6X893 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Slc44a1Q6X893 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Slc44a1Q6X893 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Slc44a1Q6X893 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Slc44a1Q6X893 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Slc44a1Q6X893 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Slc44a1Q6X893 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Slc44a1Q6X893 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Slc44a1Q6X893 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Slc44a1Q6X893 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Slc44a1Q6X893 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Slc44a1Q6X893 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Slc44a1Q6X893 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Slc44a1Q6X893 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Slc44a1Q6X893 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Slc44a1Q6X893 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Slc44a1Q6X893 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Slc44a1Q6X893 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Slc44a1Q6X893 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Slc44a1Q6X893 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Slc44a1Q6X893 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Slc44a1Q6X893 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Slc44a1Q6X893 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Slc44a1Q6X893 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Slc44a1Q6X893 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Slc44a1Q6X893 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Slc44a1Q6X893 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Slc44a1Q6X893 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Slc44a1Q6X893 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Slc44a1Q6X893 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Slc44a1Q6X893 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Slc44a1Q6X893 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Slc44a1Q6X893 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Slc44a1Q6X893 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Slc44a1Q6X893 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Slc44a1Q6X893 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Slc44a1Q6X893 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Slc44a1Q6X893 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Slc44a1Q6X893 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Slc44a1Q6X893 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Slc44a1Q6X893 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Slc44a1Q6X893 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Slc44a1Q6X893 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Slc44a1Q6X893 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Slc44a1Q6X893 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Slc44a1Q6X893 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Slc44a1Q6X893 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Slc44a1Q6X893 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Slc44a1Q6X893 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Slc44a1Q6X893 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Slc44a1Q6X893 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Slc44a1Q6X893 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Slc44a1Q6X893 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Slc44a1Q6X893 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Slc44a1Q6X893 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Slc44a1Q6X893 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Slc44a1Q6X893 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Slc44a1Q6X893 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Slc44a1Q6X893 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Slc44a1Q6X893 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Slc44a1Q6X893 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Slc44a1Q6X893 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Slc44a1Q6X893 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Slc44a1Q6X893 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Slc44a1Q6X893 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Slc44a1Q6X893 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Slc44a1Q6X893 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Slc44a1Q6X893 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Slc44a1Q6X893 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Slc44a1Q6X893 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Slc44a1Q6X893 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Slc44a1Q6X893 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Slc44a1Q6X893 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Slc44a1Q6X893 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Slc44a1Q6X893 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Slc44a1Q6X893 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Slc44a1Q6X893 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Slc44a1Q6X893 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Slc44a1Q6X893 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Slc44a1Q6X893 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Slc44a1Q6X893 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Slc44a1Q6X893 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Slc44a1Q6X893 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Slc44a1Q6X893 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Slc44a1Q6X893 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Slc44a1Q6X893 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Slc44a1Q6X893 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms