Protein–RNA interactions for Protein: Q6VZZ7

Opn5, Opsin-5, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opn5Q6VZZ7 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Opn5Q6VZZ7 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Opn5Q6VZZ7 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Opn5Q6VZZ7 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Opn5Q6VZZ7 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Opn5Q6VZZ7 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Opn5Q6VZZ7 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Opn5Q6VZZ7 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Opn5Q6VZZ7 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Opn5Q6VZZ7 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Opn5Q6VZZ7 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Opn5Q6VZZ7 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Opn5Q6VZZ7 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Opn5Q6VZZ7 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Opn5Q6VZZ7 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Opn5Q6VZZ7 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Opn5Q6VZZ7 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Opn5Q6VZZ7 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Opn5Q6VZZ7 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Opn5Q6VZZ7 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Opn5Q6VZZ7 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Opn5Q6VZZ7 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Opn5Q6VZZ7 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Opn5Q6VZZ7 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Opn5Q6VZZ7 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Opn5Q6VZZ7 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Opn5Q6VZZ7 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Opn5Q6VZZ7 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Opn5Q6VZZ7 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Opn5Q6VZZ7 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Opn5Q6VZZ7 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Opn5Q6VZZ7 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Opn5Q6VZZ7 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Opn5Q6VZZ7 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Opn5Q6VZZ7 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Opn5Q6VZZ7 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Opn5Q6VZZ7 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Opn5Q6VZZ7 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Opn5Q6VZZ7 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Opn5Q6VZZ7 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Opn5Q6VZZ7 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Opn5Q6VZZ7 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Opn5Q6VZZ7 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Opn5Q6VZZ7 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Opn5Q6VZZ7 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Opn5Q6VZZ7 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Opn5Q6VZZ7 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Opn5Q6VZZ7 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Opn5Q6VZZ7 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Opn5Q6VZZ7 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Opn5Q6VZZ7 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Opn5Q6VZZ7 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Opn5Q6VZZ7 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Opn5Q6VZZ7 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Opn5Q6VZZ7 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Opn5Q6VZZ7 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Opn5Q6VZZ7 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Opn5Q6VZZ7 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Opn5Q6VZZ7 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Opn5Q6VZZ7 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Opn5Q6VZZ7 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Opn5Q6VZZ7 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Opn5Q6VZZ7 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Opn5Q6VZZ7 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Opn5Q6VZZ7 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Opn5Q6VZZ7 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Opn5Q6VZZ7 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Opn5Q6VZZ7 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Opn5Q6VZZ7 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Opn5Q6VZZ7 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Opn5Q6VZZ7 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Opn5Q6VZZ7 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Opn5Q6VZZ7 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Opn5Q6VZZ7 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Opn5Q6VZZ7 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Opn5Q6VZZ7 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Opn5Q6VZZ7 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Opn5Q6VZZ7 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Opn5Q6VZZ7 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Opn5Q6VZZ7 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Opn5Q6VZZ7 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Opn5Q6VZZ7 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Opn5Q6VZZ7 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Opn5Q6VZZ7 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Opn5Q6VZZ7 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Opn5Q6VZZ7 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Opn5Q6VZZ7 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Opn5Q6VZZ7 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Opn5Q6VZZ7 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Opn5Q6VZZ7 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Opn5Q6VZZ7 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Opn5Q6VZZ7 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Opn5Q6VZZ7 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Opn5Q6VZZ7 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Opn5Q6VZZ7 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Opn5Q6VZZ7 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Opn5Q6VZZ7 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Opn5Q6VZZ7 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Opn5Q6VZZ7 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Opn5Q6VZZ7 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms