Protein–RNA interactions for Protein: Q6VH22

Ift172, Intraflagellar transport protein 172 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ift172Q6VH22 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ift172Q6VH22 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ift172Q6VH22 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ift172Q6VH22 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ift172Q6VH22 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ift172Q6VH22 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ift172Q6VH22 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ift172Q6VH22 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Ift172Q6VH22 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Ift172Q6VH22 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Ift172Q6VH22 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Ift172Q6VH22 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Ift172Q6VH22 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Ift172Q6VH22 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Ift172Q6VH22 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Ift172Q6VH22 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Ift172Q6VH22 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Ift172Q6VH22 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Ift172Q6VH22 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Ift172Q6VH22 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Ift172Q6VH22 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ift172Q6VH22 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ift172Q6VH22 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ift172Q6VH22 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ift172Q6VH22 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ift172Q6VH22 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ift172Q6VH22 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ift172Q6VH22 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ift172Q6VH22 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ift172Q6VH22 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ift172Q6VH22 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
Ift172Q6VH22 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ift172Q6VH22 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ift172Q6VH22 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ift172Q6VH22 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ift172Q6VH22 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ift172Q6VH22 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ift172Q6VH22 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ift172Q6VH22 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ift172Q6VH22 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ift172Q6VH22 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ift172Q6VH22 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ift172Q6VH22 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ift172Q6VH22 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ift172Q6VH22 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ift172Q6VH22 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ift172Q6VH22 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ift172Q6VH22 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ift172Q6VH22 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ift172Q6VH22 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ift172Q6VH22 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ift172Q6VH22 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Ift172Q6VH22 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ift172Q6VH22 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Ift172Q6VH22 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ift172Q6VH22 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ift172Q6VH22 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ift172Q6VH22 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ift172Q6VH22 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ift172Q6VH22 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ift172Q6VH22 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ift172Q6VH22 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ift172Q6VH22 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ift172Q6VH22 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ift172Q6VH22 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ift172Q6VH22 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Ift172Q6VH22 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ift172Q6VH22 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ift172Q6VH22 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Ift172Q6VH22 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Ift172Q6VH22 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ift172Q6VH22 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Ift172Q6VH22 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ift172Q6VH22 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ift172Q6VH22 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ift172Q6VH22 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ift172Q6VH22 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ift172Q6VH22 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ift172Q6VH22 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Ift172Q6VH22 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Ift172Q6VH22 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ift172Q6VH22 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ift172Q6VH22 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ift172Q6VH22 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ift172Q6VH22 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ift172Q6VH22 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ift172Q6VH22 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ift172Q6VH22 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ift172Q6VH22 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ift172Q6VH22 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ift172Q6VH22 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ift172Q6VH22 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ift172Q6VH22 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ift172Q6VH22 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ift172Q6VH22 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ift172Q6VH22 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ift172Q6VH22 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Ift172Q6VH22 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ift172Q6VH22 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ift172Q6VH22 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.7 ms