Protein–RNA interactions for Protein: Q6VGS5

Ccdc88c, Protein Daple, mousemouse

Predictions only

Length 2,009 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc88cQ6VGS5 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc88cQ6VGS5 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc88cQ6VGS5 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc88cQ6VGS5 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc88cQ6VGS5 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc88cQ6VGS5 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc88cQ6VGS5 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc88cQ6VGS5 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc88cQ6VGS5 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc88cQ6VGS5 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc88cQ6VGS5 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc88cQ6VGS5 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc88cQ6VGS5 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ccdc88cQ6VGS5 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ccdc88cQ6VGS5 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ccdc88cQ6VGS5 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ccdc88cQ6VGS5 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ccdc88cQ6VGS5 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ccdc88cQ6VGS5 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ccdc88cQ6VGS5 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccdc88cQ6VGS5 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccdc88cQ6VGS5 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccdc88cQ6VGS5 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccdc88cQ6VGS5 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccdc88cQ6VGS5 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccdc88cQ6VGS5 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccdc88cQ6VGS5 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccdc88cQ6VGS5 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccdc88cQ6VGS5 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccdc88cQ6VGS5 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccdc88cQ6VGS5 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc88cQ6VGS5 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc88cQ6VGS5 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc88cQ6VGS5 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc88cQ6VGS5 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc88cQ6VGS5 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc88cQ6VGS5 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc88cQ6VGS5 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc88cQ6VGS5 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc88cQ6VGS5 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc88cQ6VGS5 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc88cQ6VGS5 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc88cQ6VGS5 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc88cQ6VGS5 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc88cQ6VGS5 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc88cQ6VGS5 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc88cQ6VGS5 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc88cQ6VGS5 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc88cQ6VGS5 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc88cQ6VGS5 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc88cQ6VGS5 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc88cQ6VGS5 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc88cQ6VGS5 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc88cQ6VGS5 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc88cQ6VGS5 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc88cQ6VGS5 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc88cQ6VGS5 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc88cQ6VGS5 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc88cQ6VGS5 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc88cQ6VGS5 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc88cQ6VGS5 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc88cQ6VGS5 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc88cQ6VGS5 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc88cQ6VGS5 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc88cQ6VGS5 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc88cQ6VGS5 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc88cQ6VGS5 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc88cQ6VGS5 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc88cQ6VGS5 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc88cQ6VGS5 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc88cQ6VGS5 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc88cQ6VGS5 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc88cQ6VGS5 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc88cQ6VGS5 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc88cQ6VGS5 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc88cQ6VGS5 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc88cQ6VGS5 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc88cQ6VGS5 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc88cQ6VGS5 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc88cQ6VGS5 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc88cQ6VGS5 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc88cQ6VGS5 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc88cQ6VGS5 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc88cQ6VGS5 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc88cQ6VGS5 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc88cQ6VGS5 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc88cQ6VGS5 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc88cQ6VGS5 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc88cQ6VGS5 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc88cQ6VGS5 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc88cQ6VGS5 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc88cQ6VGS5 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc88cQ6VGS5 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc88cQ6VGS5 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc88cQ6VGS5 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc88cQ6VGS5 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc88cQ6VGS5 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc88cQ6VGS5 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc88cQ6VGS5 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc88cQ6VGS5 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms