Protein–RNA interactions for Protein: Q6RUU0

Ptx4, Pentraxin-4, mousemouse

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptx4Q6RUU0 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ptx4Q6RUU0 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ptx4Q6RUU0 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ptx4Q6RUU0 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Ptx4Q6RUU0 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ptx4Q6RUU0 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ptx4Q6RUU0 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ptx4Q6RUU0 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ptx4Q6RUU0 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ptx4Q6RUU0 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ptx4Q6RUU0 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ptx4Q6RUU0 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ptx4Q6RUU0 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ptx4Q6RUU0 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ptx4Q6RUU0 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ptx4Q6RUU0 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ptx4Q6RUU0 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ptx4Q6RUU0 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ptx4Q6RUU0 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ptx4Q6RUU0 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ptx4Q6RUU0 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ptx4Q6RUU0 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ptx4Q6RUU0 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ptx4Q6RUU0 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ptx4Q6RUU0 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ptx4Q6RUU0 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ptx4Q6RUU0 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ptx4Q6RUU0 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ptx4Q6RUU0 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ptx4Q6RUU0 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ptx4Q6RUU0 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ptx4Q6RUU0 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ptx4Q6RUU0 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ptx4Q6RUU0 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ptx4Q6RUU0 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ptx4Q6RUU0 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ptx4Q6RUU0 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ptx4Q6RUU0 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ptx4Q6RUU0 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ptx4Q6RUU0 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ptx4Q6RUU0 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ptx4Q6RUU0 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Ptx4Q6RUU0 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ptx4Q6RUU0 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ptx4Q6RUU0 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ptx4Q6RUU0 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ptx4Q6RUU0 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ptx4Q6RUU0 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Ptx4Q6RUU0 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ptx4Q6RUU0 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ptx4Q6RUU0 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ptx4Q6RUU0 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Ptx4Q6RUU0 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ptx4Q6RUU0 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ptx4Q6RUU0 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ptx4Q6RUU0 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ptx4Q6RUU0 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ptx4Q6RUU0 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ptx4Q6RUU0 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ptx4Q6RUU0 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ptx4Q6RUU0 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ptx4Q6RUU0 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ptx4Q6RUU0 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Ptx4Q6RUU0 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ptx4Q6RUU0 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ptx4Q6RUU0 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ptx4Q6RUU0 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ptx4Q6RUU0 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ptx4Q6RUU0 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ptx4Q6RUU0 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ptx4Q6RUU0 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ptx4Q6RUU0 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ptx4Q6RUU0 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ptx4Q6RUU0 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ptx4Q6RUU0 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ptx4Q6RUU0 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ptx4Q6RUU0 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ptx4Q6RUU0 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ptx4Q6RUU0 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ptx4Q6RUU0 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ptx4Q6RUU0 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ptx4Q6RUU0 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ptx4Q6RUU0 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ptx4Q6RUU0 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ptx4Q6RUU0 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ptx4Q6RUU0 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ptx4Q6RUU0 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Ptx4Q6RUU0 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ptx4Q6RUU0 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ptx4Q6RUU0 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ptx4Q6RUU0 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ptx4Q6RUU0 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ptx4Q6RUU0 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ptx4Q6RUU0 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ptx4Q6RUU0 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ptx4Q6RUU0 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ptx4Q6RUU0 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ptx4Q6RUU0 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ptx4Q6RUU0 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ptx4Q6RUU0 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms