Protein–RNA interactions for Protein: Q6PHZ8

Kcnip4, Kv channel-interacting protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnip4Q6PHZ8 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Kcnip4Q6PHZ8 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Kcnip4Q6PHZ8 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Kcnip4Q6PHZ8 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Kcnip4Q6PHZ8 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Kcnip4Q6PHZ8 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Kcnip4Q6PHZ8 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Kcnip4Q6PHZ8 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Kcnip4Q6PHZ8 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Kcnip4Q6PHZ8 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Kcnip4Q6PHZ8 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Kcnip4Q6PHZ8 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Kcnip4Q6PHZ8 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Kcnip4Q6PHZ8 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Kcnip4Q6PHZ8 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Kcnip4Q6PHZ8 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Kcnip4Q6PHZ8 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Kcnip4Q6PHZ8 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Kcnip4Q6PHZ8 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Kcnip4Q6PHZ8 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Kcnip4Q6PHZ8 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Kcnip4Q6PHZ8 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Kcnip4Q6PHZ8 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Kcnip4Q6PHZ8 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Kcnip4Q6PHZ8 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Kcnip4Q6PHZ8 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Kcnip4Q6PHZ8 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Kcnip4Q6PHZ8 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Kcnip4Q6PHZ8 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Kcnip4Q6PHZ8 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Kcnip4Q6PHZ8 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Kcnip4Q6PHZ8 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Kcnip4Q6PHZ8 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Kcnip4Q6PHZ8 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Kcnip4Q6PHZ8 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Kcnip4Q6PHZ8 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Kcnip4Q6PHZ8 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Kcnip4Q6PHZ8 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Kcnip4Q6PHZ8 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Kcnip4Q6PHZ8 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Kcnip4Q6PHZ8 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Kcnip4Q6PHZ8 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Kcnip4Q6PHZ8 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Kcnip4Q6PHZ8 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Kcnip4Q6PHZ8 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Kcnip4Q6PHZ8 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Kcnip4Q6PHZ8 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Kcnip4Q6PHZ8 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Kcnip4Q6PHZ8 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Kcnip4Q6PHZ8 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Kcnip4Q6PHZ8 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Kcnip4Q6PHZ8 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Kcnip4Q6PHZ8 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Kcnip4Q6PHZ8 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Kcnip4Q6PHZ8 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Kcnip4Q6PHZ8 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Kcnip4Q6PHZ8 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Kcnip4Q6PHZ8 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Kcnip4Q6PHZ8 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Kcnip4Q6PHZ8 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Kcnip4Q6PHZ8 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Kcnip4Q6PHZ8 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Kcnip4Q6PHZ8 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Kcnip4Q6PHZ8 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Kcnip4Q6PHZ8 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Kcnip4Q6PHZ8 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Kcnip4Q6PHZ8 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Kcnip4Q6PHZ8 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Kcnip4Q6PHZ8 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Kcnip4Q6PHZ8 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Kcnip4Q6PHZ8 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Kcnip4Q6PHZ8 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Kcnip4Q6PHZ8 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Kcnip4Q6PHZ8 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Kcnip4Q6PHZ8 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Kcnip4Q6PHZ8 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Kcnip4Q6PHZ8 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Kcnip4Q6PHZ8 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Kcnip4Q6PHZ8 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Kcnip4Q6PHZ8 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Kcnip4Q6PHZ8 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Kcnip4Q6PHZ8 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Kcnip4Q6PHZ8 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Kcnip4Q6PHZ8 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Kcnip4Q6PHZ8 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Kcnip4Q6PHZ8 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Kcnip4Q6PHZ8 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Kcnip4Q6PHZ8 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Kcnip4Q6PHZ8 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Kcnip4Q6PHZ8 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Kcnip4Q6PHZ8 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Kcnip4Q6PHZ8 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Kcnip4Q6PHZ8 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Kcnip4Q6PHZ8 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Kcnip4Q6PHZ8 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Kcnip4Q6PHZ8 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Kcnip4Q6PHZ8 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Kcnip4Q6PHZ8 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Kcnip4Q6PHZ8 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Kcnip4Q6PHZ8 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms