Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDC8

Mfsd4a, Major facilitator superfamily domain-containing protein 4A, mousemouse

Predictions only

Length 510 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mfsd4aQ6PDC8 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mfsd4aQ6PDC8 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mfsd4aQ6PDC8 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mfsd4aQ6PDC8 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mfsd4aQ6PDC8 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mfsd4aQ6PDC8 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mfsd4aQ6PDC8 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mfsd4aQ6PDC8 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mfsd4aQ6PDC8 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mfsd4aQ6PDC8 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mfsd4aQ6PDC8 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mfsd4aQ6PDC8 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mfsd4aQ6PDC8 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mfsd4aQ6PDC8 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mfsd4aQ6PDC8 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mfsd4aQ6PDC8 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mfsd4aQ6PDC8 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mfsd4aQ6PDC8 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mfsd4aQ6PDC8 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mfsd4aQ6PDC8 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mfsd4aQ6PDC8 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mfsd4aQ6PDC8 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mfsd4aQ6PDC8 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mfsd4aQ6PDC8 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mfsd4aQ6PDC8 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mfsd4aQ6PDC8 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mfsd4aQ6PDC8 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mfsd4aQ6PDC8 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mfsd4aQ6PDC8 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mfsd4aQ6PDC8 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mfsd4aQ6PDC8 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mfsd4aQ6PDC8 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mfsd4aQ6PDC8 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mfsd4aQ6PDC8 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Mfsd4aQ6PDC8 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mfsd4aQ6PDC8 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mfsd4aQ6PDC8 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mfsd4aQ6PDC8 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mfsd4aQ6PDC8 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mfsd4aQ6PDC8 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mfsd4aQ6PDC8 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mfsd4aQ6PDC8 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mfsd4aQ6PDC8 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mfsd4aQ6PDC8 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mfsd4aQ6PDC8 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mfsd4aQ6PDC8 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mfsd4aQ6PDC8 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mfsd4aQ6PDC8 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mfsd4aQ6PDC8 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Mfsd4aQ6PDC8 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mfsd4aQ6PDC8 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mfsd4aQ6PDC8 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mfsd4aQ6PDC8 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mfsd4aQ6PDC8 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mfsd4aQ6PDC8 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mfsd4aQ6PDC8 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mfsd4aQ6PDC8 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mfsd4aQ6PDC8 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mfsd4aQ6PDC8 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mfsd4aQ6PDC8 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mfsd4aQ6PDC8 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mfsd4aQ6PDC8 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mfsd4aQ6PDC8 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mfsd4aQ6PDC8 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mfsd4aQ6PDC8 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mfsd4aQ6PDC8 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Mfsd4aQ6PDC8 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mfsd4aQ6PDC8 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mfsd4aQ6PDC8 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mfsd4aQ6PDC8 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mfsd4aQ6PDC8 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mfsd4aQ6PDC8 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mfsd4aQ6PDC8 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Mfsd4aQ6PDC8 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mfsd4aQ6PDC8 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mfsd4aQ6PDC8 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mfsd4aQ6PDC8 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mfsd4aQ6PDC8 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mfsd4aQ6PDC8 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mfsd4aQ6PDC8 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mfsd4aQ6PDC8 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mfsd4aQ6PDC8 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mfsd4aQ6PDC8 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mfsd4aQ6PDC8 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mfsd4aQ6PDC8 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mfsd4aQ6PDC8 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mfsd4aQ6PDC8 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mfsd4aQ6PDC8 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mfsd4aQ6PDC8 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mfsd4aQ6PDC8 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mfsd4aQ6PDC8 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mfsd4aQ6PDC8 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mfsd4aQ6PDC8 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mfsd4aQ6PDC8 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mfsd4aQ6PDC8 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mfsd4aQ6PDC8 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mfsd4aQ6PDC8 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mfsd4aQ6PDC8 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mfsd4aQ6PDC8 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mfsd4aQ6PDC8 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms