Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDC0

Rundc3b, RUN domain-containing protein 3B, mousemouse

Predictions only

Length 408 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rundc3bQ6PDC0 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rundc3bQ6PDC0 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rundc3bQ6PDC0 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rundc3bQ6PDC0 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rundc3bQ6PDC0 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rundc3bQ6PDC0 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rundc3bQ6PDC0 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rundc3bQ6PDC0 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rundc3bQ6PDC0 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rundc3bQ6PDC0 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rundc3bQ6PDC0 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rundc3bQ6PDC0 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rundc3bQ6PDC0 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rundc3bQ6PDC0 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rundc3bQ6PDC0 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rundc3bQ6PDC0 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rundc3bQ6PDC0 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rundc3bQ6PDC0 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rundc3bQ6PDC0 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rundc3bQ6PDC0 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rundc3bQ6PDC0 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rundc3bQ6PDC0 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rundc3bQ6PDC0 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rundc3bQ6PDC0 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rundc3bQ6PDC0 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rundc3bQ6PDC0 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rundc3bQ6PDC0 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rundc3bQ6PDC0 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rundc3bQ6PDC0 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rundc3bQ6PDC0 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rundc3bQ6PDC0 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rundc3bQ6PDC0 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rundc3bQ6PDC0 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rundc3bQ6PDC0 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rundc3bQ6PDC0 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rundc3bQ6PDC0 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rundc3bQ6PDC0 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rundc3bQ6PDC0 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rundc3bQ6PDC0 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rundc3bQ6PDC0 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rundc3bQ6PDC0 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rundc3bQ6PDC0 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rundc3bQ6PDC0 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rundc3bQ6PDC0 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rundc3bQ6PDC0 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rundc3bQ6PDC0 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rundc3bQ6PDC0 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rundc3bQ6PDC0 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rundc3bQ6PDC0 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rundc3bQ6PDC0 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rundc3bQ6PDC0 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rundc3bQ6PDC0 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rundc3bQ6PDC0 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rundc3bQ6PDC0 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rundc3bQ6PDC0 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rundc3bQ6PDC0 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rundc3bQ6PDC0 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rundc3bQ6PDC0 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rundc3bQ6PDC0 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rundc3bQ6PDC0 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rundc3bQ6PDC0 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rundc3bQ6PDC0 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rundc3bQ6PDC0 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rundc3bQ6PDC0 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rundc3bQ6PDC0 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rundc3bQ6PDC0 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rundc3bQ6PDC0 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rundc3bQ6PDC0 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rundc3bQ6PDC0 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rundc3bQ6PDC0 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rundc3bQ6PDC0 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rundc3bQ6PDC0 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rundc3bQ6PDC0 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rundc3bQ6PDC0 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rundc3bQ6PDC0 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rundc3bQ6PDC0 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rundc3bQ6PDC0 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rundc3bQ6PDC0 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rundc3bQ6PDC0 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rundc3bQ6PDC0 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rundc3bQ6PDC0 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rundc3bQ6PDC0 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rundc3bQ6PDC0 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rundc3bQ6PDC0 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rundc3bQ6PDC0 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rundc3bQ6PDC0 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Rundc3bQ6PDC0 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rundc3bQ6PDC0 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rundc3bQ6PDC0 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rundc3bQ6PDC0 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rundc3bQ6PDC0 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rundc3bQ6PDC0 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rundc3bQ6PDC0 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rundc3bQ6PDC0 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rundc3bQ6PDC0 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rundc3bQ6PDC0 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rundc3bQ6PDC0 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rundc3bQ6PDC0 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rundc3bQ6PDC0 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rundc3bQ6PDC0 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.2 ms