Protein–RNA interactions for Protein: Q6PCX7

Rgma, Repulsive guidance molecule A, mousemouse

Predictions only

Length 454 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RgmaQ6PCX7 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RgmaQ6PCX7 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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RgmaQ6PCX7 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RgmaQ6PCX7 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
RgmaQ6PCX7 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RgmaQ6PCX7 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
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RgmaQ6PCX7 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RgmaQ6PCX7 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RgmaQ6PCX7 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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RgmaQ6PCX7 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RgmaQ6PCX7 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
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RgmaQ6PCX7 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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RgmaQ6PCX7 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RgmaQ6PCX7 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RgmaQ6PCX7 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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RgmaQ6PCX7 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RgmaQ6PCX7 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RgmaQ6PCX7 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RgmaQ6PCX7 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RgmaQ6PCX7 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RgmaQ6PCX7 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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RgmaQ6PCX7 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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RgmaQ6PCX7 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RgmaQ6PCX7 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RgmaQ6PCX7 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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RgmaQ6PCX7 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RgmaQ6PCX7 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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RgmaQ6PCX7 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
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RgmaQ6PCX7 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RgmaQ6PCX7 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RgmaQ6PCX7 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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RgmaQ6PCX7 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RgmaQ6PCX7 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
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RgmaQ6PCX7 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RgmaQ6PCX7 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RgmaQ6PCX7 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RgmaQ6PCX7 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RgmaQ6PCX7 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RgmaQ6PCX7 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RgmaQ6PCX7 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RgmaQ6PCX7 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RgmaQ6PCX7 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RgmaQ6PCX7 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RgmaQ6PCX7 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RgmaQ6PCX7 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RgmaQ6PCX7 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RgmaQ6PCX7 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RgmaQ6PCX7 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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