Protein–RNA interactions for Protein: Q6PCS8

Zbtb40, Zinc finger and BTB domain-containing 40, mousemouse

Predictions only

Length 1,258 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbtb40Q6PCS8 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Zbtb40Q6PCS8 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Zbtb40Q6PCS8 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Zbtb40Q6PCS8 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Zbtb40Q6PCS8 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Zbtb40Q6PCS8 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Zbtb40Q6PCS8 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Zbtb40Q6PCS8 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Zbtb40Q6PCS8 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Zbtb40Q6PCS8 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Zbtb40Q6PCS8 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Zbtb40Q6PCS8 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Zbtb40Q6PCS8 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Zbtb40Q6PCS8 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Zbtb40Q6PCS8 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Zbtb40Q6PCS8 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Zbtb40Q6PCS8 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Zbtb40Q6PCS8 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Zbtb40Q6PCS8 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Zbtb40Q6PCS8 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Zbtb40Q6PCS8 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Zbtb40Q6PCS8 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Zbtb40Q6PCS8 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Zbtb40Q6PCS8 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Zbtb40Q6PCS8 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Zbtb40Q6PCS8 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Zbtb40Q6PCS8 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Zbtb40Q6PCS8 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Zbtb40Q6PCS8 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Zbtb40Q6PCS8 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Zbtb40Q6PCS8 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Zbtb40Q6PCS8 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Zbtb40Q6PCS8 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Zbtb40Q6PCS8 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Zbtb40Q6PCS8 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Zbtb40Q6PCS8 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Zbtb40Q6PCS8 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Zbtb40Q6PCS8 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Zbtb40Q6PCS8 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Zbtb40Q6PCS8 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Zbtb40Q6PCS8 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Zbtb40Q6PCS8 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Zbtb40Q6PCS8 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Zbtb40Q6PCS8 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Zbtb40Q6PCS8 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Zbtb40Q6PCS8 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Zbtb40Q6PCS8 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Zbtb40Q6PCS8 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Zbtb40Q6PCS8 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Zbtb40Q6PCS8 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Zbtb40Q6PCS8 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Zbtb40Q6PCS8 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Zbtb40Q6PCS8 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Zbtb40Q6PCS8 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Zbtb40Q6PCS8 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Zbtb40Q6PCS8 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Zbtb40Q6PCS8 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Zbtb40Q6PCS8 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Zbtb40Q6PCS8 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Zbtb40Q6PCS8 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Zbtb40Q6PCS8 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Zbtb40Q6PCS8 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Zbtb40Q6PCS8 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Zbtb40Q6PCS8 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Zbtb40Q6PCS8 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Zbtb40Q6PCS8 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Zbtb40Q6PCS8 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Zbtb40Q6PCS8 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Zbtb40Q6PCS8 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Zbtb40Q6PCS8 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Zbtb40Q6PCS8 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Zbtb40Q6PCS8 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Zbtb40Q6PCS8 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Zbtb40Q6PCS8 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Zbtb40Q6PCS8 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Zbtb40Q6PCS8 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Zbtb40Q6PCS8 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Zbtb40Q6PCS8 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Zbtb40Q6PCS8 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Zbtb40Q6PCS8 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Zbtb40Q6PCS8 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Zbtb40Q6PCS8 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Zbtb40Q6PCS8 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Zbtb40Q6PCS8 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Zbtb40Q6PCS8 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Zbtb40Q6PCS8 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Zbtb40Q6PCS8 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Zbtb40Q6PCS8 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Zbtb40Q6PCS8 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Zbtb40Q6PCS8 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Zbtb40Q6PCS8 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Zbtb40Q6PCS8 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Zbtb40Q6PCS8 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Zbtb40Q6PCS8 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Zbtb40Q6PCS8 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Zbtb40Q6PCS8 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Zbtb40Q6PCS8 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Zbtb40Q6PCS8 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Zbtb40Q6PCS8 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Zbtb40Q6PCS8 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms