Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9Q4

Fhod1, FH1/FH2 domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,197 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fhod1Q6P9Q4 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Fhod1Q6P9Q4 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Fhod1Q6P9Q4 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Fhod1Q6P9Q4 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Fhod1Q6P9Q4 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Fhod1Q6P9Q4 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Fhod1Q6P9Q4 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Fhod1Q6P9Q4 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Fhod1Q6P9Q4 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Fhod1Q6P9Q4 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Fhod1Q6P9Q4 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Fhod1Q6P9Q4 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Fhod1Q6P9Q4 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Fhod1Q6P9Q4 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Fhod1Q6P9Q4 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Fhod1Q6P9Q4 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Fhod1Q6P9Q4 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Fhod1Q6P9Q4 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Fhod1Q6P9Q4 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Fhod1Q6P9Q4 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Fhod1Q6P9Q4 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Fhod1Q6P9Q4 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Fhod1Q6P9Q4 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Fhod1Q6P9Q4 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Fhod1Q6P9Q4 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Fhod1Q6P9Q4 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Fhod1Q6P9Q4 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Fhod1Q6P9Q4 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Fhod1Q6P9Q4 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Fhod1Q6P9Q4 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Fhod1Q6P9Q4 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Fhod1Q6P9Q4 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Fhod1Q6P9Q4 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Fhod1Q6P9Q4 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Fhod1Q6P9Q4 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Fhod1Q6P9Q4 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Fhod1Q6P9Q4 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Fhod1Q6P9Q4 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Fhod1Q6P9Q4 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Fhod1Q6P9Q4 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Fhod1Q6P9Q4 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Fhod1Q6P9Q4 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Fhod1Q6P9Q4 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Fhod1Q6P9Q4 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Fhod1Q6P9Q4 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Fhod1Q6P9Q4 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Fhod1Q6P9Q4 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Fhod1Q6P9Q4 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Fhod1Q6P9Q4 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Fhod1Q6P9Q4 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Fhod1Q6P9Q4 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Fhod1Q6P9Q4 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC19.02■□□□□ 0.63
Fhod1Q6P9Q4 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Fhod1Q6P9Q4 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Fhod1Q6P9Q4 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Fhod1Q6P9Q4 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Fhod1Q6P9Q4 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Fhod1Q6P9Q4 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Fhod1Q6P9Q4 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Fhod1Q6P9Q4 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Fhod1Q6P9Q4 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Fhod1Q6P9Q4 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Fhod1Q6P9Q4 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Fhod1Q6P9Q4 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Fhod1Q6P9Q4 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Fhod1Q6P9Q4 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Fhod1Q6P9Q4 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Fhod1Q6P9Q4 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Fhod1Q6P9Q4 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Fhod1Q6P9Q4 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Fhod1Q6P9Q4 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Fhod1Q6P9Q4 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Fhod1Q6P9Q4 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Fhod1Q6P9Q4 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Fhod1Q6P9Q4 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Fhod1Q6P9Q4 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Fhod1Q6P9Q4 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Fhod1Q6P9Q4 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Fhod1Q6P9Q4 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Fhod1Q6P9Q4 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Fhod1Q6P9Q4 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Fhod1Q6P9Q4 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Fhod1Q6P9Q4 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Fhod1Q6P9Q4 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Fhod1Q6P9Q4 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Fhod1Q6P9Q4 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Fhod1Q6P9Q4 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Fhod1Q6P9Q4 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Fhod1Q6P9Q4 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Fhod1Q6P9Q4 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Fhod1Q6P9Q4 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Fhod1Q6P9Q4 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Fhod1Q6P9Q4 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Fhod1Q6P9Q4 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Fhod1Q6P9Q4 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Fhod1Q6P9Q4 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Fhod1Q6P9Q4 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Fhod1Q6P9Q4 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Fhod1Q6P9Q4 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Fhod1Q6P9Q4 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms