Protein–RNA interactions for Protein: Q6P8I2

BC061237, MCG114023, isoform CRA_b, mousemouse

Predictions only

Length 184 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC061237Q6P8I2 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
BC061237Q6P8I2 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
BC061237Q6P8I2 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
BC061237Q6P8I2 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
BC061237Q6P8I2 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
BC061237Q6P8I2 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
BC061237Q6P8I2 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
BC061237Q6P8I2 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
BC061237Q6P8I2 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
BC061237Q6P8I2 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
BC061237Q6P8I2 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
BC061237Q6P8I2 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
BC061237Q6P8I2 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
BC061237Q6P8I2 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
BC061237Q6P8I2 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
BC061237Q6P8I2 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
BC061237Q6P8I2 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
BC061237Q6P8I2 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
BC061237Q6P8I2 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
BC061237Q6P8I2 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
BC061237Q6P8I2 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
BC061237Q6P8I2 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
BC061237Q6P8I2 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
BC061237Q6P8I2 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
BC061237Q6P8I2 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
BC061237Q6P8I2 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
BC061237Q6P8I2 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
BC061237Q6P8I2 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
BC061237Q6P8I2 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
BC061237Q6P8I2 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
BC061237Q6P8I2 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
BC061237Q6P8I2 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
BC061237Q6P8I2 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
BC061237Q6P8I2 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
BC061237Q6P8I2 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
BC061237Q6P8I2 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
BC061237Q6P8I2 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
BC061237Q6P8I2 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
BC061237Q6P8I2 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
BC061237Q6P8I2 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
BC061237Q6P8I2 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
BC061237Q6P8I2 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
BC061237Q6P8I2 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
BC061237Q6P8I2 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
BC061237Q6P8I2 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
BC061237Q6P8I2 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
BC061237Q6P8I2 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
BC061237Q6P8I2 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
BC061237Q6P8I2 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
BC061237Q6P8I2 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
BC061237Q6P8I2 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
BC061237Q6P8I2 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
BC061237Q6P8I2 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
BC061237Q6P8I2 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
BC061237Q6P8I2 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
BC061237Q6P8I2 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
BC061237Q6P8I2 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
BC061237Q6P8I2 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
BC061237Q6P8I2 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
BC061237Q6P8I2 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
BC061237Q6P8I2 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
BC061237Q6P8I2 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
BC061237Q6P8I2 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
BC061237Q6P8I2 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
BC061237Q6P8I2 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
BC061237Q6P8I2 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
BC061237Q6P8I2 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
BC061237Q6P8I2 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
BC061237Q6P8I2 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
BC061237Q6P8I2 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
BC061237Q6P8I2 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
BC061237Q6P8I2 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
BC061237Q6P8I2 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
BC061237Q6P8I2 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
BC061237Q6P8I2 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
BC061237Q6P8I2 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
BC061237Q6P8I2 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
BC061237Q6P8I2 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
BC061237Q6P8I2 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
BC061237Q6P8I2 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
BC061237Q6P8I2 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
BC061237Q6P8I2 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
BC061237Q6P8I2 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
BC061237Q6P8I2 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
BC061237Q6P8I2 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
BC061237Q6P8I2 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
BC061237Q6P8I2 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
BC061237Q6P8I2 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
BC061237Q6P8I2 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
BC061237Q6P8I2 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
BC061237Q6P8I2 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
BC061237Q6P8I2 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
BC061237Q6P8I2 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
BC061237Q6P8I2 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
BC061237Q6P8I2 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
BC061237Q6P8I2 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
BC061237Q6P8I2 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
BC061237Q6P8I2 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
BC061237Q6P8I2 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
BC061237Q6P8I2 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms