Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5U8

Ccdc148, Coiled-coil domain-containing protein 148, mousemouse

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc148Q6P5U8 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc148Q6P5U8 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc148Q6P5U8 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc148Q6P5U8 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc148Q6P5U8 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc148Q6P5U8 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc148Q6P5U8 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc148Q6P5U8 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc148Q6P5U8 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc148Q6P5U8 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc148Q6P5U8 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc148Q6P5U8 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc148Q6P5U8 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc148Q6P5U8 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc148Q6P5U8 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc148Q6P5U8 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc148Q6P5U8 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc148Q6P5U8 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc148Q6P5U8 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc148Q6P5U8 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc148Q6P5U8 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc148Q6P5U8 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc148Q6P5U8 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc148Q6P5U8 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc148Q6P5U8 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc148Q6P5U8 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc148Q6P5U8 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc148Q6P5U8 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc148Q6P5U8 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc148Q6P5U8 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc148Q6P5U8 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc148Q6P5U8 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc148Q6P5U8 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc148Q6P5U8 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc148Q6P5U8 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc148Q6P5U8 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc148Q6P5U8 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc148Q6P5U8 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc148Q6P5U8 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc148Q6P5U8 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc148Q6P5U8 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc148Q6P5U8 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc148Q6P5U8 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc148Q6P5U8 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc148Q6P5U8 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc148Q6P5U8 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc148Q6P5U8 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc148Q6P5U8 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc148Q6P5U8 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc148Q6P5U8 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc148Q6P5U8 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc148Q6P5U8 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc148Q6P5U8 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc148Q6P5U8 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc148Q6P5U8 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc148Q6P5U8 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc148Q6P5U8 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc148Q6P5U8 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc148Q6P5U8 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc148Q6P5U8 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc148Q6P5U8 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc148Q6P5U8 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc148Q6P5U8 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc148Q6P5U8 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc148Q6P5U8 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc148Q6P5U8 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc148Q6P5U8 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc148Q6P5U8 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc148Q6P5U8 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc148Q6P5U8 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc148Q6P5U8 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc148Q6P5U8 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc148Q6P5U8 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc148Q6P5U8 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc148Q6P5U8 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc148Q6P5U8 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc148Q6P5U8 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc148Q6P5U8 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc148Q6P5U8 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc148Q6P5U8 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc148Q6P5U8 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc148Q6P5U8 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc148Q6P5U8 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc148Q6P5U8 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc148Q6P5U8 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc148Q6P5U8 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc148Q6P5U8 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc148Q6P5U8 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc148Q6P5U8 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc148Q6P5U8 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc148Q6P5U8 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc148Q6P5U8 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc148Q6P5U8 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc148Q6P5U8 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
Ccdc148Q6P5U8 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ccdc148Q6P5U8 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ccdc148Q6P5U8 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc148Q6P5U8 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc148Q6P5U8 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc148Q6P5U8 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49 ms