Protein–RNA interactions for Protein: Q6P3B9

Rbfa, Putative ribosome-binding factor A, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RbfaQ6P3B9 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RbfaQ6P3B9 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RbfaQ6P3B9 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RbfaQ6P3B9 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RbfaQ6P3B9 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RbfaQ6P3B9 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RbfaQ6P3B9 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RbfaQ6P3B9 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RbfaQ6P3B9 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RbfaQ6P3B9 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RbfaQ6P3B9 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RbfaQ6P3B9 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
RbfaQ6P3B9 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RbfaQ6P3B9 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RbfaQ6P3B9 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RbfaQ6P3B9 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RbfaQ6P3B9 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RbfaQ6P3B9 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RbfaQ6P3B9 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RbfaQ6P3B9 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RbfaQ6P3B9 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RbfaQ6P3B9 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RbfaQ6P3B9 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
RbfaQ6P3B9 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RbfaQ6P3B9 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RbfaQ6P3B9 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RbfaQ6P3B9 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RbfaQ6P3B9 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RbfaQ6P3B9 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RbfaQ6P3B9 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RbfaQ6P3B9 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RbfaQ6P3B9 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RbfaQ6P3B9 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RbfaQ6P3B9 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RbfaQ6P3B9 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RbfaQ6P3B9 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RbfaQ6P3B9 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RbfaQ6P3B9 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RbfaQ6P3B9 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
RbfaQ6P3B9 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RbfaQ6P3B9 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RbfaQ6P3B9 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RbfaQ6P3B9 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RbfaQ6P3B9 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RbfaQ6P3B9 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RbfaQ6P3B9 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
RbfaQ6P3B9 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
RbfaQ6P3B9 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
RbfaQ6P3B9 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
RbfaQ6P3B9 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
RbfaQ6P3B9 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RbfaQ6P3B9 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RbfaQ6P3B9 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RbfaQ6P3B9 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RbfaQ6P3B9 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RbfaQ6P3B9 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RbfaQ6P3B9 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RbfaQ6P3B9 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RbfaQ6P3B9 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RbfaQ6P3B9 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RbfaQ6P3B9 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RbfaQ6P3B9 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RbfaQ6P3B9 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RbfaQ6P3B9 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RbfaQ6P3B9 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RbfaQ6P3B9 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RbfaQ6P3B9 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RbfaQ6P3B9 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RbfaQ6P3B9 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RbfaQ6P3B9 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RbfaQ6P3B9 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RbfaQ6P3B9 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RbfaQ6P3B9 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RbfaQ6P3B9 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RbfaQ6P3B9 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RbfaQ6P3B9 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
RbfaQ6P3B9 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RbfaQ6P3B9 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
RbfaQ6P3B9 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
RbfaQ6P3B9 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RbfaQ6P3B9 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RbfaQ6P3B9 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RbfaQ6P3B9 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RbfaQ6P3B9 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
RbfaQ6P3B9 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RbfaQ6P3B9 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RbfaQ6P3B9 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RbfaQ6P3B9 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RbfaQ6P3B9 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RbfaQ6P3B9 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RbfaQ6P3B9 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RbfaQ6P3B9 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RbfaQ6P3B9 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RbfaQ6P3B9 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RbfaQ6P3B9 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RbfaQ6P3B9 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RbfaQ6P3B9 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RbfaQ6P3B9 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RbfaQ6P3B9 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RbfaQ6P3B9 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms