Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZP2

Gpbp1l1, Vasculin-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpbp1l1Q6NZP2 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gpbp1l1Q6NZP2 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gpbp1l1Q6NZP2 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gpbp1l1Q6NZP2 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gpbp1l1Q6NZP2 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gpbp1l1Q6NZP2 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gpbp1l1Q6NZP2 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gpbp1l1Q6NZP2 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gpbp1l1Q6NZP2 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gpbp1l1Q6NZP2 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gpbp1l1Q6NZP2 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gpbp1l1Q6NZP2 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gpbp1l1Q6NZP2 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gpbp1l1Q6NZP2 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gpbp1l1Q6NZP2 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Gpbp1l1Q6NZP2 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gpbp1l1Q6NZP2 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gpbp1l1Q6NZP2 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gpbp1l1Q6NZP2 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gpbp1l1Q6NZP2 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gpbp1l1Q6NZP2 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gpbp1l1Q6NZP2 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gpbp1l1Q6NZP2 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gpbp1l1Q6NZP2 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gpbp1l1Q6NZP2 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gpbp1l1Q6NZP2 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gpbp1l1Q6NZP2 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gpbp1l1Q6NZP2 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gpbp1l1Q6NZP2 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gpbp1l1Q6NZP2 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gpbp1l1Q6NZP2 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gpbp1l1Q6NZP2 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gpbp1l1Q6NZP2 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gpbp1l1Q6NZP2 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gpbp1l1Q6NZP2 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gpbp1l1Q6NZP2 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gpbp1l1Q6NZP2 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gpbp1l1Q6NZP2 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gpbp1l1Q6NZP2 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gpbp1l1Q6NZP2 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gpbp1l1Q6NZP2 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Gpbp1l1Q6NZP2 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gpbp1l1Q6NZP2 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gpbp1l1Q6NZP2 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Gpbp1l1Q6NZP2 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gpbp1l1Q6NZP2 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gpbp1l1Q6NZP2 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gpbp1l1Q6NZP2 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gpbp1l1Q6NZP2 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gpbp1l1Q6NZP2 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gpbp1l1Q6NZP2 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gpbp1l1Q6NZP2 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gpbp1l1Q6NZP2 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gpbp1l1Q6NZP2 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Gpbp1l1Q6NZP2 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gpbp1l1Q6NZP2 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Gpbp1l1Q6NZP2 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Gpbp1l1Q6NZP2 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Gpbp1l1Q6NZP2 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gpbp1l1Q6NZP2 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gpbp1l1Q6NZP2 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gpbp1l1Q6NZP2 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gpbp1l1Q6NZP2 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gpbp1l1Q6NZP2 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gpbp1l1Q6NZP2 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gpbp1l1Q6NZP2 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gpbp1l1Q6NZP2 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gpbp1l1Q6NZP2 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gpbp1l1Q6NZP2 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gpbp1l1Q6NZP2 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gpbp1l1Q6NZP2 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gpbp1l1Q6NZP2 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gpbp1l1Q6NZP2 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gpbp1l1Q6NZP2 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gpbp1l1Q6NZP2 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gpbp1l1Q6NZP2 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gpbp1l1Q6NZP2 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gpbp1l1Q6NZP2 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gpbp1l1Q6NZP2 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gpbp1l1Q6NZP2 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gpbp1l1Q6NZP2 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gpbp1l1Q6NZP2 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gpbp1l1Q6NZP2 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gpbp1l1Q6NZP2 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gpbp1l1Q6NZP2 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gpbp1l1Q6NZP2 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gpbp1l1Q6NZP2 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gpbp1l1Q6NZP2 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gpbp1l1Q6NZP2 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms