Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZL0

Soga3, Protein SOGA3, mousemouse

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Length 945 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Soga3Q6NZL0 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Soga3Q6NZL0 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Soga3Q6NZL0 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Soga3Q6NZL0 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Soga3Q6NZL0 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Soga3Q6NZL0 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Soga3Q6NZL0 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Soga3Q6NZL0 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Soga3Q6NZL0 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Soga3Q6NZL0 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Soga3Q6NZL0 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Soga3Q6NZL0 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Soga3Q6NZL0 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Soga3Q6NZL0 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Soga3Q6NZL0 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Soga3Q6NZL0 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Soga3Q6NZL0 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Soga3Q6NZL0 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Soga3Q6NZL0 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Soga3Q6NZL0 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Soga3Q6NZL0 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Soga3Q6NZL0 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Soga3Q6NZL0 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Soga3Q6NZL0 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Soga3Q6NZL0 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Soga3Q6NZL0 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Soga3Q6NZL0 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Soga3Q6NZL0 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Soga3Q6NZL0 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Soga3Q6NZL0 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Soga3Q6NZL0 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Soga3Q6NZL0 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Soga3Q6NZL0 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Soga3Q6NZL0 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Soga3Q6NZL0 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Soga3Q6NZL0 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Soga3Q6NZL0 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Soga3Q6NZL0 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Soga3Q6NZL0 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Soga3Q6NZL0 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Soga3Q6NZL0 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Soga3Q6NZL0 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Soga3Q6NZL0 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Soga3Q6NZL0 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Soga3Q6NZL0 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Soga3Q6NZL0 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Soga3Q6NZL0 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Soga3Q6NZL0 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Soga3Q6NZL0 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Soga3Q6NZL0 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Soga3Q6NZL0 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Soga3Q6NZL0 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Soga3Q6NZL0 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Soga3Q6NZL0 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Soga3Q6NZL0 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Soga3Q6NZL0 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Soga3Q6NZL0 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Soga3Q6NZL0 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Soga3Q6NZL0 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Soga3Q6NZL0 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Soga3Q6NZL0 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Soga3Q6NZL0 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Soga3Q6NZL0 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Soga3Q6NZL0 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Soga3Q6NZL0 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Soga3Q6NZL0 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Soga3Q6NZL0 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Soga3Q6NZL0 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Soga3Q6NZL0 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Soga3Q6NZL0 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Soga3Q6NZL0 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Soga3Q6NZL0 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Soga3Q6NZL0 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Soga3Q6NZL0 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Soga3Q6NZL0 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Soga3Q6NZL0 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Soga3Q6NZL0 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Soga3Q6NZL0 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Soga3Q6NZL0 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Soga3Q6NZL0 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Soga3Q6NZL0 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Soga3Q6NZL0 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Soga3Q6NZL0 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Soga3Q6NZL0 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Soga3Q6NZL0 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Soga3Q6NZL0 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Soga3Q6NZL0 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Soga3Q6NZL0 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Soga3Q6NZL0 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Soga3Q6NZL0 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Soga3Q6NZL0 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Soga3Q6NZL0 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Soga3Q6NZL0 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Soga3Q6NZL0 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Soga3Q6NZL0 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Soga3Q6NZL0 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Soga3Q6NZL0 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Soga3Q6NZL0 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Soga3Q6NZL0 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Soga3Q6NZL0 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
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