Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXW6

Rad17, Cell cycle checkpoint protein RAD17, mousemouse

Predictions only

Length 688 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad17Q6NXW6 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rad17Q6NXW6 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rad17Q6NXW6 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rad17Q6NXW6 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rad17Q6NXW6 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rad17Q6NXW6 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rad17Q6NXW6 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rad17Q6NXW6 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rad17Q6NXW6 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rad17Q6NXW6 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Rad17Q6NXW6 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rad17Q6NXW6 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rad17Q6NXW6 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rad17Q6NXW6 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rad17Q6NXW6 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rad17Q6NXW6 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rad17Q6NXW6 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rad17Q6NXW6 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rad17Q6NXW6 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rad17Q6NXW6 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rad17Q6NXW6 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rad17Q6NXW6 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rad17Q6NXW6 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rad17Q6NXW6 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Rad17Q6NXW6 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rad17Q6NXW6 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Rad17Q6NXW6 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rad17Q6NXW6 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rad17Q6NXW6 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rad17Q6NXW6 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rad17Q6NXW6 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rad17Q6NXW6 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rad17Q6NXW6 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rad17Q6NXW6 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rad17Q6NXW6 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rad17Q6NXW6 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rad17Q6NXW6 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rad17Q6NXW6 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rad17Q6NXW6 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rad17Q6NXW6 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rad17Q6NXW6 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rad17Q6NXW6 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rad17Q6NXW6 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rad17Q6NXW6 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rad17Q6NXW6 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rad17Q6NXW6 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rad17Q6NXW6 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rad17Q6NXW6 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rad17Q6NXW6 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rad17Q6NXW6 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rad17Q6NXW6 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rad17Q6NXW6 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rad17Q6NXW6 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rad17Q6NXW6 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rad17Q6NXW6 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rad17Q6NXW6 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rad17Q6NXW6 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Rad17Q6NXW6 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rad17Q6NXW6 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rad17Q6NXW6 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rad17Q6NXW6 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rad17Q6NXW6 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rad17Q6NXW6 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rad17Q6NXW6 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rad17Q6NXW6 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rad17Q6NXW6 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rad17Q6NXW6 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rad17Q6NXW6 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rad17Q6NXW6 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rad17Q6NXW6 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rad17Q6NXW6 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rad17Q6NXW6 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rad17Q6NXW6 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rad17Q6NXW6 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rad17Q6NXW6 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rad17Q6NXW6 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rad17Q6NXW6 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rad17Q6NXW6 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rad17Q6NXW6 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rad17Q6NXW6 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rad17Q6NXW6 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rad17Q6NXW6 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rad17Q6NXW6 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rad17Q6NXW6 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rad17Q6NXW6 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rad17Q6NXW6 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rad17Q6NXW6 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rad17Q6NXW6 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rad17Q6NXW6 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rad17Q6NXW6 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rad17Q6NXW6 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Rad17Q6NXW6 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rad17Q6NXW6 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Rad17Q6NXW6 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rad17Q6NXW6 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rad17Q6NXW6 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rad17Q6NXW6 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rad17Q6NXW6 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rad17Q6NXW6 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rad17Q6NXW6 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms