Protein–RNA interactions for Protein: Q6NVF4

Helb, DNA helicase B, mousemouse

Predictions only

Length 1,074 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HelbQ6NVF4 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HelbQ6NVF4 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
HelbQ6NVF4 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HelbQ6NVF4 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HelbQ6NVF4 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HelbQ6NVF4 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HelbQ6NVF4 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HelbQ6NVF4 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HelbQ6NVF4 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HelbQ6NVF4 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HelbQ6NVF4 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HelbQ6NVF4 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HelbQ6NVF4 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HelbQ6NVF4 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HelbQ6NVF4 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HelbQ6NVF4 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HelbQ6NVF4 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
HelbQ6NVF4 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HelbQ6NVF4 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
HelbQ6NVF4 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HelbQ6NVF4 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HelbQ6NVF4 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HelbQ6NVF4 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HelbQ6NVF4 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HelbQ6NVF4 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HelbQ6NVF4 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HelbQ6NVF4 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HelbQ6NVF4 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HelbQ6NVF4 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HelbQ6NVF4 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HelbQ6NVF4 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HelbQ6NVF4 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HelbQ6NVF4 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HelbQ6NVF4 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HelbQ6NVF4 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HelbQ6NVF4 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HelbQ6NVF4 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HelbQ6NVF4 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HelbQ6NVF4 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HelbQ6NVF4 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HelbQ6NVF4 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HelbQ6NVF4 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HelbQ6NVF4 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HelbQ6NVF4 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HelbQ6NVF4 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HelbQ6NVF4 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HelbQ6NVF4 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HelbQ6NVF4 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HelbQ6NVF4 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HelbQ6NVF4 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HelbQ6NVF4 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HelbQ6NVF4 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HelbQ6NVF4 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HelbQ6NVF4 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HelbQ6NVF4 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HelbQ6NVF4 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HelbQ6NVF4 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HelbQ6NVF4 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HelbQ6NVF4 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HelbQ6NVF4 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HelbQ6NVF4 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HelbQ6NVF4 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HelbQ6NVF4 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HelbQ6NVF4 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HelbQ6NVF4 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HelbQ6NVF4 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HelbQ6NVF4 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HelbQ6NVF4 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
HelbQ6NVF4 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HelbQ6NVF4 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
HelbQ6NVF4 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HelbQ6NVF4 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HelbQ6NVF4 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HelbQ6NVF4 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
HelbQ6NVF4 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HelbQ6NVF4 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HelbQ6NVF4 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HelbQ6NVF4 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
HelbQ6NVF4 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HelbQ6NVF4 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HelbQ6NVF4 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HelbQ6NVF4 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HelbQ6NVF4 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HelbQ6NVF4 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HelbQ6NVF4 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HelbQ6NVF4 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HelbQ6NVF4 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HelbQ6NVF4 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HelbQ6NVF4 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HelbQ6NVF4 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HelbQ6NVF4 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HelbQ6NVF4 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HelbQ6NVF4 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HelbQ6NVF4 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HelbQ6NVF4 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HelbQ6NVF4 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HelbQ6NVF4 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HelbQ6NVF4 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HelbQ6NVF4 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
HelbQ6NVF4 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms