Protein–RNA interactions for Protein: Q6KAU4

Mvb12b, Multivesicular body subunit 12B, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mvb12bQ6KAU4 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Mvb12bQ6KAU4 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Mvb12bQ6KAU4 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Mvb12bQ6KAU4 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Mvb12bQ6KAU4 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mvb12bQ6KAU4 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mvb12bQ6KAU4 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mvb12bQ6KAU4 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mvb12bQ6KAU4 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mvb12bQ6KAU4 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mvb12bQ6KAU4 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mvb12bQ6KAU4 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mvb12bQ6KAU4 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mvb12bQ6KAU4 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mvb12bQ6KAU4 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Mvb12bQ6KAU4 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mvb12bQ6KAU4 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mvb12bQ6KAU4 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mvb12bQ6KAU4 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mvb12bQ6KAU4 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mvb12bQ6KAU4 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mvb12bQ6KAU4 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mvb12bQ6KAU4 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Mvb12bQ6KAU4 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Mvb12bQ6KAU4 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Mvb12bQ6KAU4 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Mvb12bQ6KAU4 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Mvb12bQ6KAU4 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Mvb12bQ6KAU4 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Mvb12bQ6KAU4 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Mvb12bQ6KAU4 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Mvb12bQ6KAU4 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Mvb12bQ6KAU4 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Mvb12bQ6KAU4 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Mvb12bQ6KAU4 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Mvb12bQ6KAU4 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
Mvb12bQ6KAU4 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Mvb12bQ6KAU4 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Mvb12bQ6KAU4 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Mvb12bQ6KAU4 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Mvb12bQ6KAU4 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Mvb12bQ6KAU4 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Mvb12bQ6KAU4 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Mvb12bQ6KAU4 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Mvb12bQ6KAU4 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Mvb12bQ6KAU4 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Mvb12bQ6KAU4 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Mvb12bQ6KAU4 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Mvb12bQ6KAU4 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Mvb12bQ6KAU4 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Mvb12bQ6KAU4 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Mvb12bQ6KAU4 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Mvb12bQ6KAU4 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Mvb12bQ6KAU4 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Mvb12bQ6KAU4 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Mvb12bQ6KAU4 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Mvb12bQ6KAU4 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Mvb12bQ6KAU4 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Mvb12bQ6KAU4 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Mvb12bQ6KAU4 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC18■□□□□ 0.47
Mvb12bQ6KAU4 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Mvb12bQ6KAU4 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Mvb12bQ6KAU4 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Mvb12bQ6KAU4 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Mvb12bQ6KAU4 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Mvb12bQ6KAU4 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Mvb12bQ6KAU4 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Mvb12bQ6KAU4 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Mvb12bQ6KAU4 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Mvb12bQ6KAU4 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Mvb12bQ6KAU4 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Mvb12bQ6KAU4 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Mvb12bQ6KAU4 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Mvb12bQ6KAU4 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Mvb12bQ6KAU4 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Mvb12bQ6KAU4 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Mvb12bQ6KAU4 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Mvb12bQ6KAU4 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Mvb12bQ6KAU4 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Mvb12bQ6KAU4 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Mvb12bQ6KAU4 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Mvb12bQ6KAU4 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Mvb12bQ6KAU4 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Mvb12bQ6KAU4 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Mvb12bQ6KAU4 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Mvb12bQ6KAU4 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Mvb12bQ6KAU4 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Mvb12bQ6KAU4 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Mvb12bQ6KAU4 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Mvb12bQ6KAU4 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Mvb12bQ6KAU4 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Mvb12bQ6KAU4 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Mvb12bQ6KAU4 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Mvb12bQ6KAU4 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Mvb12bQ6KAU4 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Mvb12bQ6KAU4 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Mvb12bQ6KAU4 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Mvb12bQ6KAU4 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Mvb12bQ6KAU4 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Mvb12bQ6KAU4 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms