Protein–RNA interactions for Protein: Q6IE21

Otud6a, OTU domain-containing protein 6A, mousemouse

Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otud6aQ6IE21 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Otud6aQ6IE21 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Otud6aQ6IE21 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Otud6aQ6IE21 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Otud6aQ6IE21 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Otud6aQ6IE21 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Otud6aQ6IE21 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Otud6aQ6IE21 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Otud6aQ6IE21 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Otud6aQ6IE21 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Otud6aQ6IE21 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Otud6aQ6IE21 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Otud6aQ6IE21 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Otud6aQ6IE21 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Otud6aQ6IE21 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Otud6aQ6IE21 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Otud6aQ6IE21 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Otud6aQ6IE21 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Otud6aQ6IE21 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Otud6aQ6IE21 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Otud6aQ6IE21 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Otud6aQ6IE21 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Otud6aQ6IE21 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Otud6aQ6IE21 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Otud6aQ6IE21 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Otud6aQ6IE21 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Otud6aQ6IE21 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Otud6aQ6IE21 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Otud6aQ6IE21 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Otud6aQ6IE21 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Otud6aQ6IE21 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Otud6aQ6IE21 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Otud6aQ6IE21 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Otud6aQ6IE21 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Otud6aQ6IE21 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Otud6aQ6IE21 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Otud6aQ6IE21 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Otud6aQ6IE21 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Otud6aQ6IE21 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Otud6aQ6IE21 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Otud6aQ6IE21 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Otud6aQ6IE21 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Otud6aQ6IE21 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Otud6aQ6IE21 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Otud6aQ6IE21 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Otud6aQ6IE21 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Otud6aQ6IE21 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Otud6aQ6IE21 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Otud6aQ6IE21 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Otud6aQ6IE21 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Otud6aQ6IE21 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Otud6aQ6IE21 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Otud6aQ6IE21 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Otud6aQ6IE21 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Otud6aQ6IE21 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Otud6aQ6IE21 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Otud6aQ6IE21 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Otud6aQ6IE21 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Otud6aQ6IE21 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Otud6aQ6IE21 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Otud6aQ6IE21 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Otud6aQ6IE21 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Otud6aQ6IE21 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Otud6aQ6IE21 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Otud6aQ6IE21 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Otud6aQ6IE21 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Otud6aQ6IE21 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Otud6aQ6IE21 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Otud6aQ6IE21 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Otud6aQ6IE21 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Otud6aQ6IE21 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Otud6aQ6IE21 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Otud6aQ6IE21 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Otud6aQ6IE21 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Otud6aQ6IE21 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Otud6aQ6IE21 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Otud6aQ6IE21 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Otud6aQ6IE21 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Otud6aQ6IE21 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Otud6aQ6IE21 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Otud6aQ6IE21 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Otud6aQ6IE21 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Otud6aQ6IE21 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Otud6aQ6IE21 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Otud6aQ6IE21 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Otud6aQ6IE21 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Otud6aQ6IE21 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Otud6aQ6IE21 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Otud6aQ6IE21 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Otud6aQ6IE21 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Otud6aQ6IE21 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Otud6aQ6IE21 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Otud6aQ6IE21 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Otud6aQ6IE21 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Otud6aQ6IE21 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Otud6aQ6IE21 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Otud6aQ6IE21 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Otud6aQ6IE21 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Otud6aQ6IE21 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Otud6aQ6IE21 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms