Protein–RNA interactions for Protein: Q6GQT6

Scap, Sterol regulatory element-binding protein cleavage-activating protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,276 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ScapQ6GQT6 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ScapQ6GQT6 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ScapQ6GQT6 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
ScapQ6GQT6 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
ScapQ6GQT6 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ScapQ6GQT6 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ScapQ6GQT6 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ScapQ6GQT6 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ScapQ6GQT6 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ScapQ6GQT6 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ScapQ6GQT6 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ScapQ6GQT6 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
ScapQ6GQT6 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ScapQ6GQT6 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ScapQ6GQT6 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ScapQ6GQT6 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ScapQ6GQT6 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ScapQ6GQT6 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ScapQ6GQT6 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ScapQ6GQT6 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ScapQ6GQT6 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ScapQ6GQT6 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ScapQ6GQT6 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ScapQ6GQT6 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
ScapQ6GQT6 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ScapQ6GQT6 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ScapQ6GQT6 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ScapQ6GQT6 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ScapQ6GQT6 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ScapQ6GQT6 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ScapQ6GQT6 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ScapQ6GQT6 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ScapQ6GQT6 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ScapQ6GQT6 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ScapQ6GQT6 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ScapQ6GQT6 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ScapQ6GQT6 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ScapQ6GQT6 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ScapQ6GQT6 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ScapQ6GQT6 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ScapQ6GQT6 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ScapQ6GQT6 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ScapQ6GQT6 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ScapQ6GQT6 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ScapQ6GQT6 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ScapQ6GQT6 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ScapQ6GQT6 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ScapQ6GQT6 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ScapQ6GQT6 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ScapQ6GQT6 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ScapQ6GQT6 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ScapQ6GQT6 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
ScapQ6GQT6 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ScapQ6GQT6 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ScapQ6GQT6 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ScapQ6GQT6 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ScapQ6GQT6 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ScapQ6GQT6 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ScapQ6GQT6 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ScapQ6GQT6 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ScapQ6GQT6 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
ScapQ6GQT6 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
ScapQ6GQT6 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ScapQ6GQT6 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ScapQ6GQT6 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ScapQ6GQT6 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ScapQ6GQT6 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ScapQ6GQT6 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ScapQ6GQT6 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ScapQ6GQT6 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ScapQ6GQT6 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ScapQ6GQT6 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ScapQ6GQT6 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ScapQ6GQT6 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ScapQ6GQT6 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ScapQ6GQT6 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ScapQ6GQT6 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ScapQ6GQT6 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ScapQ6GQT6 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ScapQ6GQT6 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
ScapQ6GQT6 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ScapQ6GQT6 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ScapQ6GQT6 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ScapQ6GQT6 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ScapQ6GQT6 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ScapQ6GQT6 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ScapQ6GQT6 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ScapQ6GQT6 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ScapQ6GQT6 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ScapQ6GQT6 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ScapQ6GQT6 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ScapQ6GQT6 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ScapQ6GQT6 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ScapQ6GQT6 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ScapQ6GQT6 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
ScapQ6GQT6 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ScapQ6GQT6 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ScapQ6GQT6 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ScapQ6GQT6 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ScapQ6GQT6 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms