Protein–RNA interactions for Protein: Q6EBV9

Atg9b, Autophagy-related protein 9B, mousemouse

Predictions only

Length 922 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg9bQ6EBV9 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Atg9bQ6EBV9 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Atg9bQ6EBV9 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Atg9bQ6EBV9 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Atg9bQ6EBV9 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Atg9bQ6EBV9 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Atg9bQ6EBV9 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Atg9bQ6EBV9 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Atg9bQ6EBV9 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Atg9bQ6EBV9 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Atg9bQ6EBV9 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Atg9bQ6EBV9 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Atg9bQ6EBV9 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Atg9bQ6EBV9 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Atg9bQ6EBV9 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Atg9bQ6EBV9 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Atg9bQ6EBV9 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Atg9bQ6EBV9 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Atg9bQ6EBV9 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Atg9bQ6EBV9 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Atg9bQ6EBV9 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Atg9bQ6EBV9 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Atg9bQ6EBV9 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Atg9bQ6EBV9 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Atg9bQ6EBV9 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Atg9bQ6EBV9 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Atg9bQ6EBV9 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Atg9bQ6EBV9 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Atg9bQ6EBV9 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Atg9bQ6EBV9 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Atg9bQ6EBV9 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Atg9bQ6EBV9 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Atg9bQ6EBV9 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Atg9bQ6EBV9 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Atg9bQ6EBV9 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Atg9bQ6EBV9 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Atg9bQ6EBV9 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Atg9bQ6EBV9 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Atg9bQ6EBV9 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Atg9bQ6EBV9 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Atg9bQ6EBV9 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Atg9bQ6EBV9 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Atg9bQ6EBV9 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Atg9bQ6EBV9 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Atg9bQ6EBV9 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Atg9bQ6EBV9 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Atg9bQ6EBV9 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Atg9bQ6EBV9 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Atg9bQ6EBV9 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Atg9bQ6EBV9 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Atg9bQ6EBV9 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Atg9bQ6EBV9 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Atg9bQ6EBV9 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Atg9bQ6EBV9 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Atg9bQ6EBV9 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Atg9bQ6EBV9 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Atg9bQ6EBV9 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Atg9bQ6EBV9 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Atg9bQ6EBV9 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Atg9bQ6EBV9 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Atg9bQ6EBV9 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Atg9bQ6EBV9 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Atg9bQ6EBV9 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Atg9bQ6EBV9 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Atg9bQ6EBV9 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Atg9bQ6EBV9 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Atg9bQ6EBV9 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Atg9bQ6EBV9 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Atg9bQ6EBV9 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Atg9bQ6EBV9 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Atg9bQ6EBV9 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Atg9bQ6EBV9 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Atg9bQ6EBV9 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Atg9bQ6EBV9 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Atg9bQ6EBV9 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Atg9bQ6EBV9 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Atg9bQ6EBV9 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Atg9bQ6EBV9 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Atg9bQ6EBV9 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Atg9bQ6EBV9 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Atg9bQ6EBV9 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Atg9bQ6EBV9 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Atg9bQ6EBV9 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Atg9bQ6EBV9 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Atg9bQ6EBV9 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Atg9bQ6EBV9 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Atg9bQ6EBV9 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Atg9bQ6EBV9 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Atg9bQ6EBV9 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Atg9bQ6EBV9 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Atg9bQ6EBV9 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Atg9bQ6EBV9 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Atg9bQ6EBV9 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Atg9bQ6EBV9 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Atg9bQ6EBV9 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Atg9bQ6EBV9 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Atg9bQ6EBV9 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Atg9bQ6EBV9 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Atg9bQ6EBV9 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Atg9bQ6EBV9 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87.6 ms