Protein–RNA interactions for Protein: Q6DIC0

Smarca2, Probable global transcription activator SNF2L2, mousemouse

Predictions only

Length 1,577 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarca2Q6DIC0 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.44
Smarca2Q6DIC0 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.44
Smarca2Q6DIC0 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
Smarca2Q6DIC0 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
Smarca2Q6DIC0 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC30.26■■■□□ 2.43
Smarca2Q6DIC0 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC30.26■■■□□ 2.43
Smarca2Q6DIC0 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
Smarca2Q6DIC0 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
Smarca2Q6DIC0 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
Smarca2Q6DIC0 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
Smarca2Q6DIC0 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
Smarca2Q6DIC0 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
Smarca2Q6DIC0 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC30.26■■■□□ 2.43
Smarca2Q6DIC0 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Smarca2Q6DIC0 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC30.25■■■□□ 2.43
Smarca2Q6DIC0 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.25■■■□□ 2.43
Smarca2Q6DIC0 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Smarca2Q6DIC0 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC30.25■■■□□ 2.43
Smarca2Q6DIC0 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Smarca2Q6DIC0 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Smarca2Q6DIC0 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC30.24■■■□□ 2.43
Smarca2Q6DIC0 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Smarca2Q6DIC0 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Smarca2Q6DIC0 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Smarca2Q6DIC0 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Smarca2Q6DIC0 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Smarca2Q6DIC0 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Smarca2Q6DIC0 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Smarca2Q6DIC0 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Smarca2Q6DIC0 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Smarca2Q6DIC0 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC30.24■■■□□ 2.43
Smarca2Q6DIC0 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC30.24■■■□□ 2.43
Smarca2Q6DIC0 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC30.24■■■□□ 2.43
Smarca2Q6DIC0 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Smarca2Q6DIC0 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Smarca2Q6DIC0 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Smarca2Q6DIC0 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
Smarca2Q6DIC0 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Smarca2Q6DIC0 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC30.23■■■□□ 2.43
Smarca2Q6DIC0 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
Smarca2Q6DIC0 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Smarca2Q6DIC0 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Smarca2Q6DIC0 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Smarca2Q6DIC0 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Smarca2Q6DIC0 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC30.22■■■□□ 2.43
Smarca2Q6DIC0 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Smarca2Q6DIC0 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Smarca2Q6DIC0 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Smarca2Q6DIC0 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Smarca2Q6DIC0 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
Smarca2Q6DIC0 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
Smarca2Q6DIC0 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Smarca2Q6DIC0 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.43
Smarca2Q6DIC0 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC30.2■■■□□ 2.43
Smarca2Q6DIC0 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC30.2■■■□□ 2.43
Smarca2Q6DIC0 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
Smarca2Q6DIC0 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.43
Smarca2Q6DIC0 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
Smarca2Q6DIC0 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
Smarca2Q6DIC0 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
Smarca2Q6DIC0 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
Smarca2Q6DIC0 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
Smarca2Q6DIC0 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC30.2■■■□□ 2.42
Smarca2Q6DIC0 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC30.2■■■□□ 2.42
Smarca2Q6DIC0 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
Smarca2Q6DIC0 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Smarca2Q6DIC0 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Smarca2Q6DIC0 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Smarca2Q6DIC0 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC30.19■■■□□ 2.42
Smarca2Q6DIC0 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC30.19■■■□□ 2.42
Smarca2Q6DIC0 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Smarca2Q6DIC0 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Smarca2Q6DIC0 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
Smarca2Q6DIC0 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Smarca2Q6DIC0 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Smarca2Q6DIC0 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Smarca2Q6DIC0 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Smarca2Q6DIC0 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Smarca2Q6DIC0 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Smarca2Q6DIC0 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Smarca2Q6DIC0 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
Smarca2Q6DIC0 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Smarca2Q6DIC0 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
Smarca2Q6DIC0 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Smarca2Q6DIC0 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Smarca2Q6DIC0 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Smarca2Q6DIC0 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC30.17■■■□□ 2.42
Smarca2Q6DIC0 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
Smarca2Q6DIC0 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Smarca2Q6DIC0 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
Smarca2Q6DIC0 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Smarca2Q6DIC0 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Smarca2Q6DIC0 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Smarca2Q6DIC0 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Smarca2Q6DIC0 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Smarca2Q6DIC0 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
Smarca2Q6DIC0 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Smarca2Q6DIC0 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Smarca2Q6DIC0 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC30.15■■■□□ 2.42
Smarca2Q6DIC0 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.6 ms