Protein–RNA interactions for Protein: Q6A0D4

Rftn1, Raftlin, mousemouse

Predictions only

Length 554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rftn1Q6A0D4 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Rftn1Q6A0D4 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rftn1Q6A0D4 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rftn1Q6A0D4 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Rftn1Q6A0D4 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rftn1Q6A0D4 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rftn1Q6A0D4 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rftn1Q6A0D4 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rftn1Q6A0D4 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rftn1Q6A0D4 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rftn1Q6A0D4 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Rftn1Q6A0D4 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rftn1Q6A0D4 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rftn1Q6A0D4 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rftn1Q6A0D4 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Rftn1Q6A0D4 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rftn1Q6A0D4 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rftn1Q6A0D4 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rftn1Q6A0D4 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rftn1Q6A0D4 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rftn1Q6A0D4 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rftn1Q6A0D4 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rftn1Q6A0D4 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rftn1Q6A0D4 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rftn1Q6A0D4 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rftn1Q6A0D4 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rftn1Q6A0D4 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rftn1Q6A0D4 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rftn1Q6A0D4 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rftn1Q6A0D4 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rftn1Q6A0D4 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rftn1Q6A0D4 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rftn1Q6A0D4 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rftn1Q6A0D4 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rftn1Q6A0D4 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Rftn1Q6A0D4 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rftn1Q6A0D4 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rftn1Q6A0D4 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rftn1Q6A0D4 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rftn1Q6A0D4 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rftn1Q6A0D4 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rftn1Q6A0D4 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rftn1Q6A0D4 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rftn1Q6A0D4 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rftn1Q6A0D4 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Rftn1Q6A0D4 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Rftn1Q6A0D4 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rftn1Q6A0D4 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rftn1Q6A0D4 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rftn1Q6A0D4 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rftn1Q6A0D4 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rftn1Q6A0D4 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rftn1Q6A0D4 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rftn1Q6A0D4 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rftn1Q6A0D4 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rftn1Q6A0D4 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Rftn1Q6A0D4 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rftn1Q6A0D4 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rftn1Q6A0D4 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rftn1Q6A0D4 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rftn1Q6A0D4 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rftn1Q6A0D4 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Rftn1Q6A0D4 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rftn1Q6A0D4 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rftn1Q6A0D4 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rftn1Q6A0D4 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Rftn1Q6A0D4 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Rftn1Q6A0D4 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rftn1Q6A0D4 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rftn1Q6A0D4 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rftn1Q6A0D4 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rftn1Q6A0D4 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rftn1Q6A0D4 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rftn1Q6A0D4 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rftn1Q6A0D4 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rftn1Q6A0D4 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rftn1Q6A0D4 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Rftn1Q6A0D4 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rftn1Q6A0D4 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rftn1Q6A0D4 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rftn1Q6A0D4 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rftn1Q6A0D4 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rftn1Q6A0D4 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rftn1Q6A0D4 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rftn1Q6A0D4 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rftn1Q6A0D4 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rftn1Q6A0D4 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rftn1Q6A0D4 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rftn1Q6A0D4 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rftn1Q6A0D4 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rftn1Q6A0D4 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rftn1Q6A0D4 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rftn1Q6A0D4 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rftn1Q6A0D4 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rftn1Q6A0D4 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rftn1Q6A0D4 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rftn1Q6A0D4 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rftn1Q6A0D4 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rftn1Q6A0D4 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rftn1Q6A0D4 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms