Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZK6

Jmjd1c, Probable JmjC domain-containing histone demethylation protein 2C, mousemouse

Predictions only

Length 2,350 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Jmjd1cQ69ZK6 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Jmjd1cQ69ZK6 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Jmjd1cQ69ZK6 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Jmjd1cQ69ZK6 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Jmjd1cQ69ZK6 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Jmjd1cQ69ZK6 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Jmjd1cQ69ZK6 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Jmjd1cQ69ZK6 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Jmjd1cQ69ZK6 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Jmjd1cQ69ZK6 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Jmjd1cQ69ZK6 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Jmjd1cQ69ZK6 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Jmjd1cQ69ZK6 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Jmjd1cQ69ZK6 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Jmjd1cQ69ZK6 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Jmjd1cQ69ZK6 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Jmjd1cQ69ZK6 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Jmjd1cQ69ZK6 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Jmjd1cQ69ZK6 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Jmjd1cQ69ZK6 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Jmjd1cQ69ZK6 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Jmjd1cQ69ZK6 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Jmjd1cQ69ZK6 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Jmjd1cQ69ZK6 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Jmjd1cQ69ZK6 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Jmjd1cQ69ZK6 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Jmjd1cQ69ZK6 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Jmjd1cQ69ZK6 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Jmjd1cQ69ZK6 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Jmjd1cQ69ZK6 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Jmjd1cQ69ZK6 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Jmjd1cQ69ZK6 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Jmjd1cQ69ZK6 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Jmjd1cQ69ZK6 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Jmjd1cQ69ZK6 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Jmjd1cQ69ZK6 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Jmjd1cQ69ZK6 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Jmjd1cQ69ZK6 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Jmjd1cQ69ZK6 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Jmjd1cQ69ZK6 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Jmjd1cQ69ZK6 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Jmjd1cQ69ZK6 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Jmjd1cQ69ZK6 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Jmjd1cQ69ZK6 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Jmjd1cQ69ZK6 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Jmjd1cQ69ZK6 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Jmjd1cQ69ZK6 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Jmjd1cQ69ZK6 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Jmjd1cQ69ZK6 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Jmjd1cQ69ZK6 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Jmjd1cQ69ZK6 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Jmjd1cQ69ZK6 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Jmjd1cQ69ZK6 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Jmjd1cQ69ZK6 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Jmjd1cQ69ZK6 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Jmjd1cQ69ZK6 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Jmjd1cQ69ZK6 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Jmjd1cQ69ZK6 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Jmjd1cQ69ZK6 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Jmjd1cQ69ZK6 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Jmjd1cQ69ZK6 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Jmjd1cQ69ZK6 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Jmjd1cQ69ZK6 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Jmjd1cQ69ZK6 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Jmjd1cQ69ZK6 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Jmjd1cQ69ZK6 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Jmjd1cQ69ZK6 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Jmjd1cQ69ZK6 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Jmjd1cQ69ZK6 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Jmjd1cQ69ZK6 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Jmjd1cQ69ZK6 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Jmjd1cQ69ZK6 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Jmjd1cQ69ZK6 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Jmjd1cQ69ZK6 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Jmjd1cQ69ZK6 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Jmjd1cQ69ZK6 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Jmjd1cQ69ZK6 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Jmjd1cQ69ZK6 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Jmjd1cQ69ZK6 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Jmjd1cQ69ZK6 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Jmjd1cQ69ZK6 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Jmjd1cQ69ZK6 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Jmjd1cQ69ZK6 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Jmjd1cQ69ZK6 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Jmjd1cQ69ZK6 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Jmjd1cQ69ZK6 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Jmjd1cQ69ZK6 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Jmjd1cQ69ZK6 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Jmjd1cQ69ZK6 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Jmjd1cQ69ZK6 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Jmjd1cQ69ZK6 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Jmjd1cQ69ZK6 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Jmjd1cQ69ZK6 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Jmjd1cQ69ZK6 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Jmjd1cQ69ZK6 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Jmjd1cQ69ZK6 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Jmjd1cQ69ZK6 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Jmjd1cQ69ZK6 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Jmjd1cQ69ZK6 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Jmjd1cQ69ZK6 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms