Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZB8

Zcchc2, Zinc finger CCHC domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,166 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zcchc2Q69ZB8 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Zcchc2Q69ZB8 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Zcchc2Q69ZB8 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Zcchc2Q69ZB8 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Zcchc2Q69ZB8 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Zcchc2Q69ZB8 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Zcchc2Q69ZB8 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Zcchc2Q69ZB8 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Zcchc2Q69ZB8 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Zcchc2Q69ZB8 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Zcchc2Q69ZB8 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Zcchc2Q69ZB8 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Zcchc2Q69ZB8 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Zcchc2Q69ZB8 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Zcchc2Q69ZB8 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Zcchc2Q69ZB8 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Zcchc2Q69ZB8 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Zcchc2Q69ZB8 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Zcchc2Q69ZB8 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Zcchc2Q69ZB8 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Zcchc2Q69ZB8 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Zcchc2Q69ZB8 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Zcchc2Q69ZB8 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Zcchc2Q69ZB8 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Zcchc2Q69ZB8 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Zcchc2Q69ZB8 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Zcchc2Q69ZB8 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Zcchc2Q69ZB8 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Zcchc2Q69ZB8 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Zcchc2Q69ZB8 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Zcchc2Q69ZB8 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Zcchc2Q69ZB8 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Zcchc2Q69ZB8 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Zcchc2Q69ZB8 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Zcchc2Q69ZB8 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Zcchc2Q69ZB8 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Zcchc2Q69ZB8 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Zcchc2Q69ZB8 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Zcchc2Q69ZB8 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Zcchc2Q69ZB8 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Zcchc2Q69ZB8 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Zcchc2Q69ZB8 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Zcchc2Q69ZB8 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Zcchc2Q69ZB8 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Zcchc2Q69ZB8 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Zcchc2Q69ZB8 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Zcchc2Q69ZB8 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Zcchc2Q69ZB8 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Zcchc2Q69ZB8 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Zcchc2Q69ZB8 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Zcchc2Q69ZB8 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Zcchc2Q69ZB8 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Zcchc2Q69ZB8 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Zcchc2Q69ZB8 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Zcchc2Q69ZB8 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Zcchc2Q69ZB8 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Zcchc2Q69ZB8 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Zcchc2Q69ZB8 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Zcchc2Q69ZB8 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Zcchc2Q69ZB8 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Zcchc2Q69ZB8 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Zcchc2Q69ZB8 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Zcchc2Q69ZB8 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Zcchc2Q69ZB8 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Zcchc2Q69ZB8 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Zcchc2Q69ZB8 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Zcchc2Q69ZB8 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Zcchc2Q69ZB8 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Zcchc2Q69ZB8 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Zcchc2Q69ZB8 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Zcchc2Q69ZB8 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Zcchc2Q69ZB8 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Zcchc2Q69ZB8 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Zcchc2Q69ZB8 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Zcchc2Q69ZB8 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Zcchc2Q69ZB8 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Zcchc2Q69ZB8 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Zcchc2Q69ZB8 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Zcchc2Q69ZB8 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Zcchc2Q69ZB8 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Zcchc2Q69ZB8 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Zcchc2Q69ZB8 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Zcchc2Q69ZB8 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Zcchc2Q69ZB8 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Zcchc2Q69ZB8 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Zcchc2Q69ZB8 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Zcchc2Q69ZB8 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Zcchc2Q69ZB8 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Zcchc2Q69ZB8 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Zcchc2Q69ZB8 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Zcchc2Q69ZB8 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Zcchc2Q69ZB8 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Zcchc2Q69ZB8 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Zcchc2Q69ZB8 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Zcchc2Q69ZB8 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Zcchc2Q69ZB8 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Zcchc2Q69ZB8 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Zcchc2Q69ZB8 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Zcchc2Q69ZB8 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Zcchc2Q69ZB8 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.3 ms