Protein–RNA interactions for Protein: Q69Z26

Cntn4, Contactin-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,026 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntn4Q69Z26 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Cntn4Q69Z26 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Cntn4Q69Z26 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cntn4Q69Z26 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cntn4Q69Z26 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cntn4Q69Z26 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cntn4Q69Z26 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cntn4Q69Z26 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cntn4Q69Z26 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cntn4Q69Z26 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Cntn4Q69Z26 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cntn4Q69Z26 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cntn4Q69Z26 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cntn4Q69Z26 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cntn4Q69Z26 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cntn4Q69Z26 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cntn4Q69Z26 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cntn4Q69Z26 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cntn4Q69Z26 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cntn4Q69Z26 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cntn4Q69Z26 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cntn4Q69Z26 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cntn4Q69Z26 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cntn4Q69Z26 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cntn4Q69Z26 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cntn4Q69Z26 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cntn4Q69Z26 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cntn4Q69Z26 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cntn4Q69Z26 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cntn4Q69Z26 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cntn4Q69Z26 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Cntn4Q69Z26 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cntn4Q69Z26 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cntn4Q69Z26 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cntn4Q69Z26 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cntn4Q69Z26 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cntn4Q69Z26 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cntn4Q69Z26 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cntn4Q69Z26 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cntn4Q69Z26 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cntn4Q69Z26 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cntn4Q69Z26 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cntn4Q69Z26 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cntn4Q69Z26 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cntn4Q69Z26 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cntn4Q69Z26 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cntn4Q69Z26 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Cntn4Q69Z26 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cntn4Q69Z26 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cntn4Q69Z26 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cntn4Q69Z26 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cntn4Q69Z26 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cntn4Q69Z26 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cntn4Q69Z26 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cntn4Q69Z26 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cntn4Q69Z26 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cntn4Q69Z26 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cntn4Q69Z26 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cntn4Q69Z26 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cntn4Q69Z26 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cntn4Q69Z26 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cntn4Q69Z26 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cntn4Q69Z26 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cntn4Q69Z26 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cntn4Q69Z26 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cntn4Q69Z26 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cntn4Q69Z26 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cntn4Q69Z26 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cntn4Q69Z26 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cntn4Q69Z26 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cntn4Q69Z26 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Cntn4Q69Z26 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cntn4Q69Z26 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cntn4Q69Z26 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cntn4Q69Z26 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cntn4Q69Z26 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cntn4Q69Z26 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cntn4Q69Z26 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cntn4Q69Z26 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cntn4Q69Z26 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cntn4Q69Z26 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cntn4Q69Z26 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cntn4Q69Z26 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cntn4Q69Z26 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cntn4Q69Z26 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cntn4Q69Z26 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cntn4Q69Z26 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cntn4Q69Z26 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cntn4Q69Z26 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cntn4Q69Z26 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cntn4Q69Z26 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cntn4Q69Z26 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cntn4Q69Z26 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cntn4Q69Z26 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Cntn4Q69Z26 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cntn4Q69Z26 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cntn4Q69Z26 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cntn4Q69Z26 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cntn4Q69Z26 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cntn4Q69Z26 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms