Protein–RNA interactions for Protein: Q68FD9

Kiaa1549, UPF0606 protein KIAA1549, mousemouse

Predictions only

Length 1,940 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kiaa1549Q68FD9 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Kiaa1549Q68FD9 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Kiaa1549Q68FD9 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Kiaa1549Q68FD9 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Kiaa1549Q68FD9 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Kiaa1549Q68FD9 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Kiaa1549Q68FD9 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Kiaa1549Q68FD9 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Kiaa1549Q68FD9 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Kiaa1549Q68FD9 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Kiaa1549Q68FD9 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Kiaa1549Q68FD9 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Kiaa1549Q68FD9 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Kiaa1549Q68FD9 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Kiaa1549Q68FD9 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Kiaa1549Q68FD9 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Kiaa1549Q68FD9 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Kiaa1549Q68FD9 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Kiaa1549Q68FD9 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Kiaa1549Q68FD9 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Kiaa1549Q68FD9 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Kiaa1549Q68FD9 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Kiaa1549Q68FD9 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Kiaa1549Q68FD9 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Kiaa1549Q68FD9 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Kiaa1549Q68FD9 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Kiaa1549Q68FD9 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Kiaa1549Q68FD9 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Kiaa1549Q68FD9 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Kiaa1549Q68FD9 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Kiaa1549Q68FD9 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Kiaa1549Q68FD9 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Kiaa1549Q68FD9 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Kiaa1549Q68FD9 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Kiaa1549Q68FD9 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Kiaa1549Q68FD9 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Kiaa1549Q68FD9 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Kiaa1549Q68FD9 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Kiaa1549Q68FD9 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Kiaa1549Q68FD9 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Kiaa1549Q68FD9 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Kiaa1549Q68FD9 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Kiaa1549Q68FD9 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Kiaa1549Q68FD9 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Kiaa1549Q68FD9 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Kiaa1549Q68FD9 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Kiaa1549Q68FD9 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Kiaa1549Q68FD9 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Kiaa1549Q68FD9 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Kiaa1549Q68FD9 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Kiaa1549Q68FD9 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Kiaa1549Q68FD9 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Kiaa1549Q68FD9 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Kiaa1549Q68FD9 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Kiaa1549Q68FD9 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Kiaa1549Q68FD9 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Kiaa1549Q68FD9 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Kiaa1549Q68FD9 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Kiaa1549Q68FD9 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Kiaa1549Q68FD9 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Kiaa1549Q68FD9 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Kiaa1549Q68FD9 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
Kiaa1549Q68FD9 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Kiaa1549Q68FD9 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Kiaa1549Q68FD9 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Kiaa1549Q68FD9 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Kiaa1549Q68FD9 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Kiaa1549Q68FD9 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Kiaa1549Q68FD9 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Kiaa1549Q68FD9 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Kiaa1549Q68FD9 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Kiaa1549Q68FD9 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Kiaa1549Q68FD9 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Kiaa1549Q68FD9 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Kiaa1549Q68FD9 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Kiaa1549Q68FD9 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Kiaa1549Q68FD9 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Kiaa1549Q68FD9 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Kiaa1549Q68FD9 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Kiaa1549Q68FD9 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Kiaa1549Q68FD9 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Kiaa1549Q68FD9 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Kiaa1549Q68FD9 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Kiaa1549Q68FD9 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Kiaa1549Q68FD9 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Kiaa1549Q68FD9 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Kiaa1549Q68FD9 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Kiaa1549Q68FD9 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Kiaa1549Q68FD9 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Kiaa1549Q68FD9 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Kiaa1549Q68FD9 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Kiaa1549Q68FD9 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Kiaa1549Q68FD9 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Kiaa1549Q68FD9 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Kiaa1549Q68FD9 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Kiaa1549Q68FD9 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Kiaa1549Q68FD9 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Kiaa1549Q68FD9 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Kiaa1549Q68FD9 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Kiaa1549Q68FD9 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.9 ms