Protein–RNA interactions for Protein: Q68FD5

Cltc, Clathrin heavy chain 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,675 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CltcQ68FD5 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CltcQ68FD5 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
CltcQ68FD5 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CltcQ68FD5 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CltcQ68FD5 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CltcQ68FD5 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CltcQ68FD5 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CltcQ68FD5 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CltcQ68FD5 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CltcQ68FD5 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CltcQ68FD5 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CltcQ68FD5 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
CltcQ68FD5 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CltcQ68FD5 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CltcQ68FD5 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CltcQ68FD5 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CltcQ68FD5 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CltcQ68FD5 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CltcQ68FD5 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CltcQ68FD5 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CltcQ68FD5 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CltcQ68FD5 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CltcQ68FD5 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CltcQ68FD5 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CltcQ68FD5 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CltcQ68FD5 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
CltcQ68FD5 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
CltcQ68FD5 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CltcQ68FD5 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
CltcQ68FD5 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CltcQ68FD5 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CltcQ68FD5 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CltcQ68FD5 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CltcQ68FD5 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CltcQ68FD5 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CltcQ68FD5 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
CltcQ68FD5 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CltcQ68FD5 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CltcQ68FD5 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CltcQ68FD5 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CltcQ68FD5 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CltcQ68FD5 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CltcQ68FD5 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CltcQ68FD5 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CltcQ68FD5 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CltcQ68FD5 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
CltcQ68FD5 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CltcQ68FD5 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
CltcQ68FD5 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
CltcQ68FD5 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CltcQ68FD5 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
CltcQ68FD5 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CltcQ68FD5 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CltcQ68FD5 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CltcQ68FD5 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CltcQ68FD5 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CltcQ68FD5 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CltcQ68FD5 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CltcQ68FD5 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CltcQ68FD5 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CltcQ68FD5 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CltcQ68FD5 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CltcQ68FD5 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
CltcQ68FD5 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CltcQ68FD5 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CltcQ68FD5 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CltcQ68FD5 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CltcQ68FD5 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CltcQ68FD5 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CltcQ68FD5 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CltcQ68FD5 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CltcQ68FD5 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CltcQ68FD5 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CltcQ68FD5 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CltcQ68FD5 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CltcQ68FD5 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CltcQ68FD5 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CltcQ68FD5 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CltcQ68FD5 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CltcQ68FD5 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CltcQ68FD5 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CltcQ68FD5 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
CltcQ68FD5 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CltcQ68FD5 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CltcQ68FD5 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CltcQ68FD5 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CltcQ68FD5 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
CltcQ68FD5 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CltcQ68FD5 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CltcQ68FD5 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CltcQ68FD5 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CltcQ68FD5 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CltcQ68FD5 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CltcQ68FD5 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
CltcQ68FD5 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CltcQ68FD5 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CltcQ68FD5 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CltcQ68FD5 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CltcQ68FD5 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CltcQ68FD5 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.4 ms