Protein–RNA interactions for Protein: Q66X22

Nlrp9b, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 9B, mousemouse

Predictions only

Length 1,003 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp9bQ66X22 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Nlrp9bQ66X22 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Nlrp9bQ66X22 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Nlrp9bQ66X22 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Nlrp9bQ66X22 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Nlrp9bQ66X22 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Nlrp9bQ66X22 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Nlrp9bQ66X22 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Nlrp9bQ66X22 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Nlrp9bQ66X22 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Nlrp9bQ66X22 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Nlrp9bQ66X22 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Nlrp9bQ66X22 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Nlrp9bQ66X22 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Nlrp9bQ66X22 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Nlrp9bQ66X22 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Nlrp9bQ66X22 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Nlrp9bQ66X22 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Nlrp9bQ66X22 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Nlrp9bQ66X22 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Nlrp9bQ66X22 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Nlrp9bQ66X22 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Nlrp9bQ66X22 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Nlrp9bQ66X22 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Nlrp9bQ66X22 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Nlrp9bQ66X22 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Nlrp9bQ66X22 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Nlrp9bQ66X22 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Nlrp9bQ66X22 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Nlrp9bQ66X22 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Nlrp9bQ66X22 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Nlrp9bQ66X22 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Nlrp9bQ66X22 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Nlrp9bQ66X22 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Nlrp9bQ66X22 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Nlrp9bQ66X22 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Nlrp9bQ66X22 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Nlrp9bQ66X22 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Nlrp9bQ66X22 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Nlrp9bQ66X22 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Nlrp9bQ66X22 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Nlrp9bQ66X22 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Nlrp9bQ66X22 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Nlrp9bQ66X22 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Nlrp9bQ66X22 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Nlrp9bQ66X22 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Nlrp9bQ66X22 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Nlrp9bQ66X22 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Nlrp9bQ66X22 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Nlrp9bQ66X22 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Nlrp9bQ66X22 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Nlrp9bQ66X22 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Nlrp9bQ66X22 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Nlrp9bQ66X22 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Nlrp9bQ66X22 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Nlrp9bQ66X22 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Nlrp9bQ66X22 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Nlrp9bQ66X22 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Nlrp9bQ66X22 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Nlrp9bQ66X22 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Nlrp9bQ66X22 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Nlrp9bQ66X22 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Nlrp9bQ66X22 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Nlrp9bQ66X22 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Nlrp9bQ66X22 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Nlrp9bQ66X22 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Nlrp9bQ66X22 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Nlrp9bQ66X22 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Nlrp9bQ66X22 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Nlrp9bQ66X22 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Nlrp9bQ66X22 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Nlrp9bQ66X22 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Nlrp9bQ66X22 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Nlrp9bQ66X22 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Nlrp9bQ66X22 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Nlrp9bQ66X22 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Nlrp9bQ66X22 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Nlrp9bQ66X22 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Nlrp9bQ66X22 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Nlrp9bQ66X22 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Nlrp9bQ66X22 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Nlrp9bQ66X22 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Nlrp9bQ66X22 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Nlrp9bQ66X22 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Nlrp9bQ66X22 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Nlrp9bQ66X22 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Nlrp9bQ66X22 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Nlrp9bQ66X22 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Nlrp9bQ66X22 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
Nlrp9bQ66X22 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Nlrp9bQ66X22 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Nlrp9bQ66X22 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
Nlrp9bQ66X22 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Nlrp9bQ66X22 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Nlrp9bQ66X22 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
Nlrp9bQ66X22 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Nlrp9bQ66X22 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Nlrp9bQ66X22 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Nlrp9bQ66X22 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
Nlrp9bQ66X22 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms