Protein–RNA interactions for Protein: Q66X19

Nlrp4e, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 4E, mousemouse

Predictions only

Length 978 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp4eQ66X19 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nlrp4eQ66X19 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nlrp4eQ66X19 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nlrp4eQ66X19 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nlrp4eQ66X19 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nlrp4eQ66X19 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nlrp4eQ66X19 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nlrp4eQ66X19 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nlrp4eQ66X19 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nlrp4eQ66X19 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nlrp4eQ66X19 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nlrp4eQ66X19 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nlrp4eQ66X19 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nlrp4eQ66X19 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Nlrp4eQ66X19 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Nlrp4eQ66X19 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nlrp4eQ66X19 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Nlrp4eQ66X19 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nlrp4eQ66X19 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nlrp4eQ66X19 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nlrp4eQ66X19 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nlrp4eQ66X19 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nlrp4eQ66X19 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nlrp4eQ66X19 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nlrp4eQ66X19 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nlrp4eQ66X19 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nlrp4eQ66X19 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nlrp4eQ66X19 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nlrp4eQ66X19 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nlrp4eQ66X19 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nlrp4eQ66X19 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nlrp4eQ66X19 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nlrp4eQ66X19 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nlrp4eQ66X19 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nlrp4eQ66X19 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nlrp4eQ66X19 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nlrp4eQ66X19 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nlrp4eQ66X19 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nlrp4eQ66X19 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nlrp4eQ66X19 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nlrp4eQ66X19 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nlrp4eQ66X19 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nlrp4eQ66X19 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nlrp4eQ66X19 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nlrp4eQ66X19 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nlrp4eQ66X19 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nlrp4eQ66X19 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Nlrp4eQ66X19 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Nlrp4eQ66X19 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nlrp4eQ66X19 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Nlrp4eQ66X19 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nlrp4eQ66X19 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Nlrp4eQ66X19 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nlrp4eQ66X19 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nlrp4eQ66X19 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nlrp4eQ66X19 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nlrp4eQ66X19 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nlrp4eQ66X19 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nlrp4eQ66X19 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nlrp4eQ66X19 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nlrp4eQ66X19 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nlrp4eQ66X19 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nlrp4eQ66X19 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nlrp4eQ66X19 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nlrp4eQ66X19 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nlrp4eQ66X19 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nlrp4eQ66X19 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nlrp4eQ66X19 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nlrp4eQ66X19 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nlrp4eQ66X19 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Nlrp4eQ66X19 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nlrp4eQ66X19 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nlrp4eQ66X19 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nlrp4eQ66X19 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nlrp4eQ66X19 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nlrp4eQ66X19 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nlrp4eQ66X19 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nlrp4eQ66X19 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nlrp4eQ66X19 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nlrp4eQ66X19 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nlrp4eQ66X19 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Nlrp4eQ66X19 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nlrp4eQ66X19 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nlrp4eQ66X19 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nlrp4eQ66X19 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nlrp4eQ66X19 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Nlrp4eQ66X19 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Nlrp4eQ66X19 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nlrp4eQ66X19 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nlrp4eQ66X19 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nlrp4eQ66X19 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nlrp4eQ66X19 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nlrp4eQ66X19 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nlrp4eQ66X19 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nlrp4eQ66X19 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Nlrp4eQ66X19 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nlrp4eQ66X19 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nlrp4eQ66X19 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nlrp4eQ66X19 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nlrp4eQ66X19 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.5 ms