Protein–RNA interactions for Protein: Q66X01

Nlrp9c, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 9C, mousemouse

Predictions only

Length 1,004 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp9cQ66X01 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nlrp9cQ66X01 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nlrp9cQ66X01 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nlrp9cQ66X01 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nlrp9cQ66X01 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nlrp9cQ66X01 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nlrp9cQ66X01 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nlrp9cQ66X01 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nlrp9cQ66X01 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nlrp9cQ66X01 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nlrp9cQ66X01 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nlrp9cQ66X01 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nlrp9cQ66X01 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nlrp9cQ66X01 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nlrp9cQ66X01 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Nlrp9cQ66X01 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Nlrp9cQ66X01 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nlrp9cQ66X01 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nlrp9cQ66X01 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nlrp9cQ66X01 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nlrp9cQ66X01 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nlrp9cQ66X01 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nlrp9cQ66X01 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nlrp9cQ66X01 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nlrp9cQ66X01 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nlrp9cQ66X01 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nlrp9cQ66X01 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Nlrp9cQ66X01 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nlrp9cQ66X01 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nlrp9cQ66X01 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nlrp9cQ66X01 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nlrp9cQ66X01 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nlrp9cQ66X01 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Nlrp9cQ66X01 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nlrp9cQ66X01 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nlrp9cQ66X01 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nlrp9cQ66X01 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nlrp9cQ66X01 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nlrp9cQ66X01 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nlrp9cQ66X01 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nlrp9cQ66X01 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Nlrp9cQ66X01 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Nlrp9cQ66X01 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Nlrp9cQ66X01 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Nlrp9cQ66X01 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Nlrp9cQ66X01 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Nlrp9cQ66X01 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Nlrp9cQ66X01 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Nlrp9cQ66X01 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Nlrp9cQ66X01 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Nlrp9cQ66X01 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Nlrp9cQ66X01 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Nlrp9cQ66X01 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Nlrp9cQ66X01 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Nlrp9cQ66X01 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Nlrp9cQ66X01 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Nlrp9cQ66X01 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Nlrp9cQ66X01 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Nlrp9cQ66X01 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Nlrp9cQ66X01 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nlrp9cQ66X01 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nlrp9cQ66X01 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nlrp9cQ66X01 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nlrp9cQ66X01 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nlrp9cQ66X01 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nlrp9cQ66X01 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nlrp9cQ66X01 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nlrp9cQ66X01 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nlrp9cQ66X01 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nlrp9cQ66X01 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nlrp9cQ66X01 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nlrp9cQ66X01 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nlrp9cQ66X01 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nlrp9cQ66X01 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nlrp9cQ66X01 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nlrp9cQ66X01 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nlrp9cQ66X01 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nlrp9cQ66X01 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nlrp9cQ66X01 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Nlrp9cQ66X01 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nlrp9cQ66X01 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nlrp9cQ66X01 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nlrp9cQ66X01 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nlrp9cQ66X01 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nlrp9cQ66X01 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nlrp9cQ66X01 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nlrp9cQ66X01 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nlrp9cQ66X01 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nlrp9cQ66X01 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nlrp9cQ66X01 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nlrp9cQ66X01 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nlrp9cQ66X01 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nlrp9cQ66X01 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nlrp9cQ66X01 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Nlrp9cQ66X01 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nlrp9cQ66X01 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nlrp9cQ66X01 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nlrp9cQ66X01 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nlrp9cQ66X01 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nlrp9cQ66X01 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.1 ms