Protein–RNA interactions for Protein: Q66JY6

Arhgef39, Rho guanine nucleotide exchange factor 39, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arhgef39Q66JY6 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Arhgef39Q66JY6 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Arhgef39Q66JY6 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Arhgef39Q66JY6 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Arhgef39Q66JY6 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Arhgef39Q66JY6 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Arhgef39Q66JY6 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Arhgef39Q66JY6 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Arhgef39Q66JY6 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Arhgef39Q66JY6 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Arhgef39Q66JY6 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Arhgef39Q66JY6 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Arhgef39Q66JY6 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Arhgef39Q66JY6 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Arhgef39Q66JY6 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Arhgef39Q66JY6 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Arhgef39Q66JY6 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Arhgef39Q66JY6 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Arhgef39Q66JY6 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Arhgef39Q66JY6 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Arhgef39Q66JY6 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Arhgef39Q66JY6 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Arhgef39Q66JY6 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Arhgef39Q66JY6 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Arhgef39Q66JY6 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Arhgef39Q66JY6 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Arhgef39Q66JY6 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Arhgef39Q66JY6 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Arhgef39Q66JY6 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Arhgef39Q66JY6 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Arhgef39Q66JY6 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Arhgef39Q66JY6 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Arhgef39Q66JY6 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Arhgef39Q66JY6 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Arhgef39Q66JY6 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Arhgef39Q66JY6 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Arhgef39Q66JY6 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Arhgef39Q66JY6 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Arhgef39Q66JY6 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Arhgef39Q66JY6 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Arhgef39Q66JY6 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Arhgef39Q66JY6 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Arhgef39Q66JY6 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Arhgef39Q66JY6 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Arhgef39Q66JY6 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Arhgef39Q66JY6 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Arhgef39Q66JY6 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Arhgef39Q66JY6 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Arhgef39Q66JY6 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Arhgef39Q66JY6 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Arhgef39Q66JY6 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Arhgef39Q66JY6 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Arhgef39Q66JY6 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Arhgef39Q66JY6 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Arhgef39Q66JY6 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Arhgef39Q66JY6 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Arhgef39Q66JY6 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Arhgef39Q66JY6 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Arhgef39Q66JY6 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Arhgef39Q66JY6 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Arhgef39Q66JY6 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Arhgef39Q66JY6 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Arhgef39Q66JY6 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Arhgef39Q66JY6 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Arhgef39Q66JY6 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Arhgef39Q66JY6 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Arhgef39Q66JY6 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Arhgef39Q66JY6 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Arhgef39Q66JY6 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Arhgef39Q66JY6 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Arhgef39Q66JY6 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Arhgef39Q66JY6 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Arhgef39Q66JY6 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Arhgef39Q66JY6 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Arhgef39Q66JY6 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Arhgef39Q66JY6 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Arhgef39Q66JY6 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Arhgef39Q66JY6 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Arhgef39Q66JY6 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Arhgef39Q66JY6 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Arhgef39Q66JY6 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Arhgef39Q66JY6 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Arhgef39Q66JY6 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Arhgef39Q66JY6 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Arhgef39Q66JY6 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Arhgef39Q66JY6 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Arhgef39Q66JY6 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Arhgef39Q66JY6 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Arhgef39Q66JY6 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Arhgef39Q66JY6 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Arhgef39Q66JY6 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Arhgef39Q66JY6 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Arhgef39Q66JY6 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Arhgef39Q66JY6 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Arhgef39Q66JY6 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Arhgef39Q66JY6 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Arhgef39Q66JY6 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Arhgef39Q66JY6 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Arhgef39Q66JY6 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Arhgef39Q66JY6 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
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