Protein–RNA interactions for Protein: Q64HY3

Sp9, Transcription factor Sp9, mousemouse

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Length 484 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sp9Q64HY3 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sp9Q64HY3 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sp9Q64HY3 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sp9Q64HY3 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sp9Q64HY3 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sp9Q64HY3 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sp9Q64HY3 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sp9Q64HY3 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Sp9Q64HY3 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sp9Q64HY3 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sp9Q64HY3 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sp9Q64HY3 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sp9Q64HY3 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sp9Q64HY3 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sp9Q64HY3 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sp9Q64HY3 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sp9Q64HY3 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sp9Q64HY3 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sp9Q64HY3 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sp9Q64HY3 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sp9Q64HY3 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sp9Q64HY3 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sp9Q64HY3 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sp9Q64HY3 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sp9Q64HY3 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sp9Q64HY3 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Sp9Q64HY3 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sp9Q64HY3 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sp9Q64HY3 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sp9Q64HY3 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sp9Q64HY3 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Sp9Q64HY3 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Sp9Q64HY3 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sp9Q64HY3 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sp9Q64HY3 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Sp9Q64HY3 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Sp9Q64HY3 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Sp9Q64HY3 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Sp9Q64HY3 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Sp9Q64HY3 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Sp9Q64HY3 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Sp9Q64HY3 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Sp9Q64HY3 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Sp9Q64HY3 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sp9Q64HY3 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sp9Q64HY3 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sp9Q64HY3 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sp9Q64HY3 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sp9Q64HY3 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sp9Q64HY3 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sp9Q64HY3 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
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Sp9Q64HY3 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sp9Q64HY3 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
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Sp9Q64HY3 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
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Sp9Q64HY3 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sp9Q64HY3 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sp9Q64HY3 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sp9Q64HY3 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
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Sp9Q64HY3 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
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Sp9Q64HY3 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
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Sp9Q64HY3 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sp9Q64HY3 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sp9Q64HY3 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sp9Q64HY3 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sp9Q64HY3 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sp9Q64HY3 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sp9Q64HY3 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sp9Q64HY3 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
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Sp9Q64HY3 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sp9Q64HY3 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sp9Q64HY3 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sp9Q64HY3 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Sp9Q64HY3 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sp9Q64HY3 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sp9Q64HY3 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sp9Q64HY3 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sp9Q64HY3 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sp9Q64HY3 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sp9Q64HY3 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sp9Q64HY3 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sp9Q64HY3 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sp9Q64HY3 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sp9Q64HY3 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sp9Q64HY3 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms